16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4058 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4058  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  540  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4566  hypothetical protein  36.5 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1982  hypothetical protein  42.08 
 
 		 290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4969  hypothetical protein  35.74 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1992  hypothetical protein  35.27 
 
 		 282 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1965  hypothetical protein  35.27 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7863  hypothetical protein  44.7 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  31.76 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  30.48 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  30.99 
 
 		 951 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  28.92 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2600  hypothetical protein  33.73 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0721  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  38.81 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  27.61 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1033  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  27.03 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000831458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4118  hypothetical protein  31.78 
 
 		 353 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>