32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4969 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4969  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  579  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4566  hypothetical protein  55.87 
 
 		 286 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1992  hypothetical protein  58.36 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1965  hypothetical protein  58.36 
 
 		 282 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1982  hypothetical protein  56.54 
 
 		 290 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4058  hypothetical protein  35.74 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7863  hypothetical protein  38.13 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  28.02 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  30 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  26.37 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4111  hypothetical protein  28.24 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50950  Electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.33 
 
 		 366 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0710127  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1033  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  27.14 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000831458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02967  electron transport complex protein RnfD  32.46 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19240  Electron transport complex, subunit D  23.02 
 
 		 343 aa  49.7  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0080  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.8 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0300271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  30.64 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1495  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  26.4 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476973  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  26.61 
 
 		 951 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1160  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  22.66 
 
 		 338 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1542  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  26.4 
 
 		 352 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.142338 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002946  electron transport complex protein RnfD  31.58 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  27.67 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0343  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  24.58 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2041  electron transport complex protein RnfD  31.09 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.460383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0735  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.67 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.170289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  26.29 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4510  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  23.28 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000355636 
 
 
-
 
NC_002950  PG0305  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  23.19 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7000  hypothetical protein  25.96 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574951 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0535  electron transport complex protein RnfD  27.52 
 
 		 348 aa  42.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134913  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1664  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  25.37 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>