191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02967 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02967  electron transport complex protein RnfD  100 
 
 		 328 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002946  electron transport complex protein RnfD  93.29 
 
 		 348 aa  617  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0535  electron transport complex protein RnfD  73.48 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1869  electron transport complex protein RnfD  65.85 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2237  electron transport complex protein RnfD  58.66 
 
 		 361 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2067  electron transport complex protein RnfD  58.54 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0541155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1908  electron transport complex protein RnfD  58.54 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2171  electron transport complex protein RnfD  58.84 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0839879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2022  electron transport complex protein RnfD  58.66 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2511  electron transport complex protein RnfD  58.23 
 
 		 349 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2322  electron transport complex protein RnfD  57.75 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2276  electron transport complex protein RnfD  57.45 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.034866  normal  0.800478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2109  electron transport complex protein RnfD  57.45 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2157  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  60.79 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.853366  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4548  electron transport complex protein RnfD  57.62 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2262  electron transport complex protein RnfD  57.62 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1818  electron transport complex protein RnfD  57.14 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452065  decreased coverage  0.000391515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1847  electron transport complex protein RnfD  57.75 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000941791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2062  electron transport complex protein RnfD  57.45 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000244661  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01600  electron transport complex protein RnfD  57.67 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2041  electron transport complex protein RnfD  56.4 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.460383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2559  electron transport complex protein RnfD  56.71 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01590  hypothetical protein  57.67 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0216636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2011  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  57.06 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1706  electron transport complex protein RnfD  57.06 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19724  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2356  electron transport complex protein RnfD  55.79 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1838  electron transport complex protein RnfD  57.06 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00396997  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1819  electron transport complex protein RnfD  57.06 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1569  electron transport complex protein RnfD  57.36 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.08013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2342  electron transport complex protein RnfD  57.36 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0357526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1999  electron transport complex protein RnfD  57.67 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00297126  normal  0.240124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2175  electron transport complex protein RnfD  56.23 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.164146  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2010  electron transport complex protein RnfD  58.97 
 
 		 364 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.079391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1898  electron transport complex protein RnfD  59.27 
 
 		 351 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000890803  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1566  electron transport complex protein RnfD  57.75 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.094034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1554  electron transport complex protein RnfD  57.75 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.52008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1718  electron transport complex protein RnfD  57.75 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447234  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1626  electron transport complex protein RnfD  57.75 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  0.410442 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2250  electron transport complex protein RnfD  58.66 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000198545  normal  0.637976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1886  electron transport complex protein RnfD  57.45 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2968  electron transport complex protein RnfD  55.18 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1866  electron transport complex protein RnfD  55.26 
 
 		 350 aa  361  8e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2069  electron transport complex protein RnfD  56.92 
 
 		 350 aa  359  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0735  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  51.99 
 
 		 350 aa  349  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.170289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02732  electron transport complex protein RnfD  52.71 
 
 		 342 aa  345  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2196  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  50.91 
 
 		 353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1062  electron transport complex protein RnfD  50 
 
 		 363 aa  342  4e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2896  electron transport complex, D subunit  54.27 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478147  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1833  electron transport complex protein RnfD  55.32 
 
 		 348 aa  341  8e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.457327  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1919  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  57.53 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2629  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  48.48 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2403  electron transport complex protein RnfD  50.89 
 
 		 357 aa  318  7e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.469732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0935  electron transport complex protein RnfD  51.82 
 
 		 350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.495036  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1793  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  50 
 
 		 353 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1542  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  49.55 
 
 		 352 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.142338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19240  Electron transport complex, subunit D  48.79 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1172  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  49.39 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3235  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  45.9 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.467841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1033  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  44.07 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000831458  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1401  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  48.04 
 
 		 343 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1784  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  46.18 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1160  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  46.36 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18910  hypothetical protein  48.18 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00596612  normal  0.053372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1637  hypothetical protein  48.18 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2018  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  47.56 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4510  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  41.82 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000355636 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3195  RnfD protein  44.97 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3934  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  44.65 
 
 		 362 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00796702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2821  electron transport complex, D subunit  39.29 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0813  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  43.83 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.337614  normal  0.474705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50950  Electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  42.77 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0710127  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.77 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0687  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  40.24 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1495  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  40.47 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476973  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0286  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  40.6 
 
 		 357 aa  218  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2992  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  41.39 
 
 		 357 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0262  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfD subunit-like  37.76 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0388  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.38 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0987  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  39.94 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.379961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1311  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  39.18 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1124  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  42.39 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1156  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  38.74 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0703  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  38.04 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0679  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  38.04 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1530  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  38.68 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0274515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1572  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.97 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.732649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1135  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  39.76 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0721  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  37.17 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270161  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0611  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.06 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.798046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1095  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  40.3 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1082  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.95 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4317  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  41.04 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0080  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.77 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0300271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1092  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  38.11 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14340  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.05 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000923733  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0305  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.04 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1326  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.82 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000145207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0212  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.45 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0013917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2698  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.75 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0784392  normal  0.0118792 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2431  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.85 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000125331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>