189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2431 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2431  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  100 
 
 		 321 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000125331  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1326  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  52.78 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000145207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1664  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  51.91 
 
 		 326 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0080  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  50.3 
 
 		 335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0300271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0212  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  46.76 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0013917  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0343  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  50.63 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0388  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  48.62 
 
 		 325 aa  288  8e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0611  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  46.27 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.798046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0262  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfD subunit-like  45.96 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14340  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  45.71 
 
 		 307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000923733  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1572  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  46.86 
 
 		 318 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.732649  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0987  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  48.69 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.379961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0698  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  47.2 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.936145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0703  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  46.98 
 
 		 318 aa  266  5e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0679  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  46.98 
 
 		 318 aa  266  5e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1156  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  48.68 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1311  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  45.16 
 
 		 330 aa  261  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0837  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, B subunit  42.99 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0305  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  46.77 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1092  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  48.44 
 
 		 318 aa  248  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1530  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  47.42 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0274515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2698  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  44.55 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0784392  normal  0.0118792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1082  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  41.27 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0687  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  41.43 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0495  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  39.75 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00551024  hitchhiker  0.00264587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1495  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  38.44 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476973  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0307  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  40.31 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0928728  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1569  electron transport complex protein RnfD  37.04 
 
 		 352 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.08013  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2011  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  37.04 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875517  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2342  electron transport complex protein RnfD  37.04 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0357526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1706  electron transport complex protein RnfD  37.04 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19724  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01600  electron transport complex protein RnfD  37.04 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01590  hypothetical protein  37.04 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0216636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1819  electron transport complex protein RnfD  37.04 
 
 		 352 aa  208  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1838  electron transport complex protein RnfD  37.04 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00396997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2594  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  38.72 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1999  electron transport complex protein RnfD  37.04 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00297126  normal  0.240124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1718  electron transport complex protein RnfD  35.61 
 
 		 352 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1818  electron transport complex protein RnfD  35.06 
 
 		 350 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452065  decreased coverage  0.000391515 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1566  electron transport complex protein RnfD  35.61 
 
 		 352 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.094034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1554  electron transport complex protein RnfD  35.61 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.52008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1626  electron transport complex protein RnfD  35.61 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  0.410442 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2821  electron transport complex, D subunit  33.91 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50950  Electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  38.3 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0710127  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1886  electron transport complex protein RnfD  35.33 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2237  electron transport complex protein RnfD  34.08 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2322  electron transport complex protein RnfD  35.03 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2022  electron transport complex protein RnfD  34.46 
 
 		 351 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2010  electron transport complex protein RnfD  34.75 
 
 		 364 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.079391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1160  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.22 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2629  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.96 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1898  electron transport complex protein RnfD  35.34 
 
 		 351 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000890803  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3195  RnfD protein  36.95 
 
 		 362 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2250  electron transport complex protein RnfD  34.46 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000198545  normal  0.637976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2196  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.76 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3934  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  37.24 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00796702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.36 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002946  electron transport complex protein RnfD  34.67 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1062  electron transport complex protein RnfD  33.61 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2896  electron transport complex, D subunit  33.33 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0735  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.27 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.170289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3235  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.93 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.467841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2175  electron transport complex protein RnfD  34.1 
 
 		 350 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.164146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1401  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.93 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0540  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  37.34 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2968  electron transport complex protein RnfD  33.43 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2992  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  39.64 
 
 		 357 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2157  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.1 
 
 		 350 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.853366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02967  electron transport complex protein RnfD  34.85 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1833  electron transport complex protein RnfD  35.47 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.457327  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0935  electron transport complex protein RnfD  33.63 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.495036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2403  electron transport complex protein RnfD  34.57 
 
 		 357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.469732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0535  electron transport complex protein RnfD  34.48 
 
 		 348 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2041  electron transport complex protein RnfD  32.09 
 
 		 350 aa  172  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.460383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1847  electron transport complex protein RnfD  33.43 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000941791  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2511  electron transport complex protein RnfD  33.62 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2356  electron transport complex protein RnfD  32.08 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0064  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  38.18 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19240  Electron transport complex, subunit D  31.14 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2171  electron transport complex protein RnfD  32.48 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0839879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1866  electron transport complex protein RnfD  32.76 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0286  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.09 
 
 		 357 aa  169  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02732  electron transport complex protein RnfD  34.5 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2067  electron transport complex protein RnfD  32.19 
 
 		 349 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0541155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1908  electron transport complex protein RnfD  32.19 
 
 		 349 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1734  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.61 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2559  electron transport complex protein RnfD  31.01 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2276  electron transport complex protein RnfD  33.33 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.034866  normal  0.800478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2109  electron transport complex protein RnfD  33.33 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2062  electron transport complex protein RnfD  33.33 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000244661  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4548  electron transport complex protein RnfD  33.33 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2262  electron transport complex protein RnfD  33.33 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00632091  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1784  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.39 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2069  electron transport complex protein RnfD  33.14 
 
 		 350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18910  hypothetical protein  33.93 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00596612  normal  0.053372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1172  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.57 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1637  hypothetical protein  34.23 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1033  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.29 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000831458  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1692  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  33.15 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.269427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0975  NQR2 and RnfD family protein  35.44 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>