More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2539 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1131 aa  2315    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  39.75 
 
 
1016 aa  721    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  26.88 
 
 
1124 aa  309  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  30.35 
 
 
1143 aa  306  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  28.27 
 
 
1128 aa  287  8e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  28.73 
 
 
1153 aa  285  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  27.41 
 
 
1112 aa  281  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.82 
 
 
1085 aa  281  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  28 
 
 
1153 aa  267  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  28.15 
 
 
1077 aa  258  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  26.83 
 
 
1109 aa  249  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  28.24 
 
 
1083 aa  248  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  26.91 
 
 
1078 aa  247  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  27.22 
 
 
1080 aa  247  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  26.59 
 
 
1077 aa  246  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  28.12 
 
 
1069 aa  246  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  26.85 
 
 
1140 aa  245  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  28.17 
 
 
1064 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  29.43 
 
 
1071 aa  243  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  25.79 
 
 
1067 aa  238  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.69 
 
 
1086 aa  236  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  28.42 
 
 
1072 aa  234  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  27.09 
 
 
1065 aa  233  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  26.86 
 
 
1089 aa  232  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.39 
 
 
1051 aa  231  7e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  28.04 
 
 
1086 aa  231  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  27.41 
 
 
1100 aa  230  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  28.14 
 
 
1075 aa  230  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 
1086 aa  228  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  25.88 
 
 
1081 aa  228  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.56 
 
 
853 aa  224  9e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  27.4 
 
 
1052 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  26.95 
 
 
1074 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  29.57 
 
 
1090 aa  222  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  27.63 
 
 
1065 aa  221  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  24.64 
 
 
1082 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  27.52 
 
 
1078 aa  218  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  26.26 
 
 
1160 aa  217  9e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  27.62 
 
 
1077 aa  217  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  27.72 
 
 
1075 aa  214  7e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  27.97 
 
 
1053 aa  206  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  26.58 
 
 
1075 aa  201  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.7 
 
 
1127 aa  195  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  26.11 
 
 
1087 aa  194  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  25.08 
 
 
1099 aa  192  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  25.21 
 
 
1122 aa  172  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.79 
 
 
1060 aa  172  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  24.76 
 
 
1109 aa  156  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.27 
 
 
1125 aa  155  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  24.11 
 
 
1065 aa  148  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  26.22 
 
 
963 aa  122  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  26.47 
 
 
975 aa  121  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  26.39 
 
 
696 aa  110  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  25.77 
 
 
961 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  25.24 
 
 
1172 aa  107  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  25.87 
 
 
1170 aa  105  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  26.04 
 
 
1160 aa  104  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  25.12 
 
 
1172 aa  101  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  27.27 
 
 
964 aa  98.2  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  26.02 
 
 
1117 aa  97.4  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  24.4 
 
 
1194 aa  94  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  23.7 
 
 
1082 aa  92.8  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  24.64 
 
 
1168 aa  92.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  24.55 
 
 
1169 aa  91.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  23.98 
 
 
1170 aa  90.1  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  24.23 
 
 
1169 aa  89.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  33.54 
 
 
819 aa  88.2  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  25.59 
 
 
919 aa  87  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  25.7 
 
 
1058 aa  87  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  24.39 
 
 
877 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  29.35 
 
 
760 aa  85.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  23.75 
 
 
829 aa  85.1  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  25.13 
 
 
948 aa  84.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  23.59 
 
 
1160 aa  83.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  23.72 
 
 
1147 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  22.78 
 
 
952 aa  82.4  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  23.46 
 
 
1137 aa  82  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  24.21 
 
 
969 aa  82  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  22.8 
 
 
1062 aa  81.6  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  29 
 
 
1046 aa  81.6  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  24.23 
 
 
1167 aa  81.3  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  24.06 
 
 
1212 aa  81.6  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  24.44 
 
 
964 aa  81.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  24.04 
 
 
1138 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  30.86 
 
 
813 aa  81.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  23.88 
 
 
1170 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  23.47 
 
 
1167 aa  79.7  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30.4 
 
 
955 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.63 
 
 
933 aa  79.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  30.69 
 
 
1065 aa  79.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  30.69 
 
 
1065 aa  79.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  24.09 
 
 
1170 aa  78.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  23.91 
 
 
1136 aa  78.2  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  25.88 
 
 
560 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.89 
 
 
949 aa  77.4  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  25.88 
 
 
560 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  25.88 
 
 
560 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  24.65 
 
 
1129 aa  78.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  23.93 
 
 
1167 aa  77.4  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  25.57 
 
 
1031 aa  77.4  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>