230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0135 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 386 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  47.57 
 
 		 816 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  52.87 
 
 		 1150 aa  79.7  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  51.14 
 
 		 775 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  50.6 
 
 		 1916 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  52.22 
 
 		 1057 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  47.13 
 
 		 677 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  50 
 
 		 2066 aa  73.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  50 
 
 		 778 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  53.57 
 
 		 1565 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  50 
 
 		 778 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  50 
 
 		 778 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  40.54 
 
 		 780 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  50 
 
 		 778 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.81 
 
 		 1158 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  48.15 
 
 		 792 aa  69.7  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  45.88 
 
 		 601 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.67 
 
 		 940 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  44.32 
 
 		 944 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  44.32 
 
 		 944 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  36.45 
 
 		 971 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  45.12 
 
 		 777 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  44.32 
 
 		 944 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  44.71 
 
 		 943 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  44.32 
 
 		 944 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  44.32 
 
 		 948 aa  67  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  44.14 
 
 		 623 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.67 
 
 		 942 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 		 947 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  49.35 
 
 		 884 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  47.13 
 
 		 712 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  41.76 
 
 		 1151 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  43.18 
 
 		 823 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.91 
 
 		 944 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  39.36 
 
 		 1084 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  39.76 
 
 		 971 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  42.68 
 
 		 713 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  40.7 
 
 		 861 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  35.51 
 
 		 967 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  35.58 
 
 		 814 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  45.56 
 
 		 734 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  40.48 
 
 		 971 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  42.16 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  40.48 
 
 		 1018 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  45.88 
 
 		 596 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  38.55 
 
 		 971 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.68 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  38.55 
 
 		 971 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  38.55 
 
 		 971 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  38.55 
 
 		 971 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  29.7 
 
 		 1104 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  29.7 
 
 		 1104 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  40.48 
 
 		 971 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  38.2 
 
 		 1601 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  49.3 
 
 		 948 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  50.72 
 
 		 948 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  37.35 
 
 		 971 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  44.19 
 
 		 1135 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.76 
 
 		 6885 aa  59.7  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  49.3 
 
 		 948 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  39 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 		 945 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.63 
 
 		 955 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  38.46 
 
 		 873 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.31 
 
 		 773 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  44.59 
 
 		 1441 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  38.64 
 
 		 786 aa  56.6  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  33.66 
 
 		 965 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  33.66 
 
 		 965 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  33.66 
 
 		 965 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  33.66 
 
 		 965 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.11 
 
 		 945 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  39.56 
 
 		 909 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  33.66 
 
 		 965 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  44.71 
 
 		 552 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  49.33 
 
 		 669 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  48.33 
 
 		 1667 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  33.66 
 
 		 965 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  44.59 
 
 		 670 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  37.36 
 
 		 1027 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  38.89 
 
 		 3197 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  40 
 
 		 2031 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  32.67 
 
 		 965 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  32.67 
 
 		 965 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  44.26 
 
 		 774 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  31.68 
 
 		 965 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  32.32 
 
 		 965 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  37.21 
 
 		 2176 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  29.41 
 
 		 840 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  35.78 
 
 		 3197 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7462  PKD domain containing protein  42.86 
 
 		 975 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  40.54 
 
 		 1050 aa  53.9  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.08 
 
 		 699 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  41.89 
 
 		 917 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  41.11 
 
 		 852 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  42.06 
 
 		 317 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  43.33 
 
 		 521 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  50 
 
 		 938 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  39.02 
 
 		 918 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  40.58 
 
 		 960 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>