279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4988 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 246 aa  480  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 200 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 209 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  54.65 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  49 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  48.24 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  49.33 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.25 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  51.16 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  33.78 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  32.45 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 497 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>