More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3762 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
353 aa  706    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  58.04 
 
 
391 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  57.32 
 
 
371 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  58.59 
 
 
349 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  45.48 
 
 
356 aa  269  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
364 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 
374 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 
358 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
815 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  29.63 
 
 
342 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.42 
 
 
1668 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.58 
 
 
1663 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  34.95 
 
 
744 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
1654 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
613 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
3706 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
771 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.52 
 
 
1239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  27.52 
 
 
918 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
771 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.18 
 
 
754 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
872 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  36.7 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
439 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
358 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.73 
 
 
783 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
1560 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
1253 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
488 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
1183 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
964 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
1093 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  32 
 
 
746 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
361 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
551 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
526 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
387 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
215 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
932 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
752 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
878 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
1714 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
362 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
572 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
913 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
382 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
532 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31 
 
 
1093 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
355 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
1093 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
461 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
363 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
991 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
832 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
1177 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
681 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
941 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
839 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
360 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
732 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
674 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
2693 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
547 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
747 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
764 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
362 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
524 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
788 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
909 aa  99.4  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
1390 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
465 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
347 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
767 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
1051 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
1227 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
603 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
834 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
366 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
492 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  29.49 
 
 
475 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
790 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  27.24 
 
 
1210 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
945 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  29.18 
 
 
1289 aa  96.3  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
732 aa  95.9  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
362 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
980 aa  95.9  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
749 aa  95.9  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  27.84 
 
 
704 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
500 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
1676 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
462 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
856 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.28 
 
 
945 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  32.83 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
408 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>