More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1211 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0190  type II and III secretion system protein  98.95 
 
 		 380 aa  746    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1211  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 380 aa  753    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0347  type II and III secretion system protein  43.08 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000362536  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2274  protein yitk  93.48 
 
 		 128 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.555431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1100  ABC transporter ATP-binding protein YojI  27.38 
 
 		 389 aa  96.7  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0019  hypothetical protein  27.38 
 
 		 389 aa  96.7  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  27.37 
 
 		 660 aa  84.3  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  24.11 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  23.77 
 
 		 779 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  26.43 
 
 		 641 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  24.44 
 
 		 747 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  23.74 
 
 		 752 aa  69.7  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1457  type II and III secretion system protein  25.1 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447998  normal  0.0646338 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  30.85 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  25.59 
 
 		 829 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  24.51 
 
 		 784 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2703  type II and III secretion system protein  27.33 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1698  type II/III secretion system protein  24.79 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  25.98 
 
 		 648 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  24.55 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  23.93 
 
 		 675 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2693  type II and III secretion system protein  24.73 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  25.27 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  26.58 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  22.74 
 
 		 672 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  24.63 
 
 		 662 aa  63.5  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  23.05 
 
 		 819 aa  63.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  30.56 
 
 		 508 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  26.11 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  25.19 
 
 		 776 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  24.64 
 
 		 636 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  24.57 
 
 		 491 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  22.88 
 
 		 635 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  27.41 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  22.86 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  23.46 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  21.83 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1994  type II and III secretion system protein  24.83 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  23.68 
 
 		 702 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  23.9 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  29.25 
 
 		 580 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  25.48 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_002620  TC0045  type III secretion protein SctC  25.56 
 
 		 672 aa  60.8  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  22.26 
 
 		 801 aa  60.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 763 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0735  type II and III secretion system protein  33.58 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  22.73 
 
 		 781 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  23.6 
 
 		 753 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  22.73 
 
 		 781 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  21.79 
 
 		 803 aa  60.1  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  23.94 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  23.94 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  23.94 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  23.94 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  23.94 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  25.79 
 
 		 697 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  22.67 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  22.22 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  24.16 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5069  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  24.3 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.240332 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  25.44 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  22.87 
 
 		 780 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  21.68 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  27.15 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  23.83 
 
 		 726 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  23.27 
 
 		 711 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  22.86 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  25.9 
 
 		 492 aa  57  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  22.86 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3025  type II/III secretion system protein  20.88 
 
 		 576 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  21.15 
 
 		 812 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  21.63 
 
 		 475 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  24.16 
 
 		 457 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  29.17 
 
 		 870 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  25.65 
 
 		 547 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  21.67 
 
 		 673 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  25.19 
 
 		 658 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  21.32 
 
 		 736 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  23.4 
 
 		 810 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  22.45 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  22.45 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  22.45 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.78 
 
 		 894 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  22.45 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  22.45 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  21.79 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  21.17 
 
 		 573 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  22.45 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  29.8 
 
 		 882 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  22.22 
 
 		 670 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  22.32 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  24.49 
 
 		 751 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  22.54 
 
 		 650 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  31.13 
 
 		 887 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  29.8 
 
 		 887 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  23.87 
 
 		 716 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  25.67 
 
 		 422 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  20.09 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  27.65 
 
 		 796 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1791  type II and III secretion system protein  20.14 
 
 		 524 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.561359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>