More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13268 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  59.52 
 
 		 841 aa  1038    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  100 
 
 		 828 aa  1674    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  32.4 
 
 		 838 aa  426  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  29.36 
 
 		 855 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  29.91 
 
 		 853 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  29.05 
 
 		 848 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  27.59 
 
 		 856 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  28.79 
 
 		 839 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  27.75 
 
 		 853 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  27.71 
 
 		 857 aa  311  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  26.87 
 
 		 843 aa  291  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  26.94 
 
 		 877 aa  271  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  26.35 
 
 		 831 aa  190  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  23.58 
 
 		 829 aa  152  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  24.17 
 
 		 816 aa  148  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  24.6 
 
 		 828 aa  144  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  22.28 
 
 		 814 aa  122  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  22.15 
 
 		 811 aa  111  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  21.58 
 
 		 849 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1008 aa  70.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 		 1119 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  37.04 
 
 		 1040 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  25.38 
 
 		 905 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 		 1109 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  38.26 
 
 		 1016 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 874 aa  64.3  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1081 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  36.28 
 
 		 979 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  36.19 
 
 		 1003 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1127 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 1192 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1046 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1019 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1102 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1056 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  36.59 
 
 		 1103 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 1020 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1095 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1152 aa  61.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 1038 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 1049 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 		 1003 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  36.7 
 
 		 1139 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1082 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 1040 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  35.87 
 
 		 1237 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  35.64 
 
 		 1071 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 1083 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1117 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1137 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1021 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1077 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  30.97 
 
 		 1002 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1148 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  37.89 
 
 		 1074 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 986 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  30.63 
 
 		 993 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1078 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 1008 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1142 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  29.6 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1165 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 999 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  30.65 
 
 		 1129 aa  57.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1006 aa  57.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1122 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 1188 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  20.66 
 
 		 930 aa  57.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  32.46 
 
 		 1080 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  33.05 
 
 		 1043 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 929 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.5 
 
 		 1063 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 988 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 1093 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1096 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1043 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1105 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1045 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1177 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 1107 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 1045 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  35.58 
 
 		 1010 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1146 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 987 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1155 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1059 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1047 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1114 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1106 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1023 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1024 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1055 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1063 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 998 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1127 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1137 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  38.54 
 
 		 1084 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 791 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>