137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0027 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  39.72 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 249 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 264 aa  89.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 234 aa  84.7  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3377  hypothetical protein  41.59 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.752265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1892  TetR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 243 aa  72  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.94 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  28.88 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  31.69 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  27.95 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  30.48 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 240 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 209 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  30.3 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0041  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  24.16 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 242 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 232 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 423 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  28.75 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 195 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 195 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  27.32 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  32.46 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 333 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 414 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>