106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6754 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  59.6 
 
 
288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  55.43 
 
 
842 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  47.47 
 
 
287 aa  238  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  46.99 
 
 
275 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  47.92 
 
 
275 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  43.07 
 
 
277 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  37.2 
 
 
486 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  34.7 
 
 
691 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  34.67 
 
 
427 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  35.32 
 
 
465 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 
686 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  29.48 
 
 
475 aa  92  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  35.98 
 
 
320 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 
608 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4545  hypothetical protein  30 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.23 
 
 
282 aa  86.3  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  28.77 
 
 
883 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.18 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.94 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  32.08 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 
1321 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 
907 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.21 
 
 
633 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.8 
 
 
1694 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.65 
 
 
627 aa  72.8  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  30.49 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  30.15 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  28.08 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  27.72 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  32.1 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  26.94 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  32.7 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.18 
 
 
547 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  27.55 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  26.7 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 
556 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  25.13 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  33.13 
 
 
588 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  28.93 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 
1332 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  28.22 
 
 
642 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  28.22 
 
 
641 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  26.5 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  29.41 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  31.9 
 
 
1059 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  27.98 
 
 
503 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 
469 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.07 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  30.73 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  29.19 
 
 
569 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3131  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  25.24 
 
 
389 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 
301 aa  58.9  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  29.11 
 
 
291 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  27.27 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.08 
 
 
532 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.52 
 
 
752 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 
449 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0446  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511543  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.9 
 
 
1290 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 
384 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  26.9 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  28.66 
 
 
346 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3037  glycoside hydrolase family 16  27.98 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0766336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0416  twin-arginine translocation pathway signal  28.06 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.18 
 
 
358 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0425  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0404  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.131377  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.32 
 
 
819 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2952  glycoside hydrolase family 16  27.18 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123961  hitchhiker  0.0028074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2950  hypothetical protein  27.27 
 
 
285 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.483524  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.27 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3145  glycoside hydrolase family 16  27.52 
 
 
300 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544499  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 
694 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.54 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.74 
 
 
884 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.18 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.53 
 
 
912 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  22.8 
 
 
742 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  25.24 
 
 
1441 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  25 
 
 
1028 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.03 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2605  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 
191 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  25.16 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  26.61 
 
 
1918 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  23.58 
 
 
722 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  29.82 
 
 
313 aa  47  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  29.19 
 
 
334 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  27.27 
 
 
238 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  23.38 
 
 
1707 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  26.96 
 
 
294 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  27.37 
 
 
467 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  22.22 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>