153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3756 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  58.08 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  44.76 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  44.65 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  41.63 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  39.23 
 
 		 212 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 228 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 228 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 233 aa  125  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  37.06 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  35.58 
 
 		 205 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  59.02 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  42.74 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  49.18 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 214 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 210 aa  48.5  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  38.81 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 189 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  34.82 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 206 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  47.92 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  46.38 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  44.07 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  46 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 461 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 186 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  30.91 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>