More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2205 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2205  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  915    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3317  MATE efflux family protein  50 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3542  MATE efflux family protein  48.9 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3694  MATE efflux family protein  47.4 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5998  MATE efflux family protein  44.5 
 
 		 486 aa  306  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.926416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0048  MATE efflux family protein  45.95 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0048  MATE efflux family protein  47.15 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4118  MATE efflux family protein  46.31 
 
 		 468 aa  290  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3795  MATE efflux family protein  45.8 
 
 		 468 aa  287  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1345  multi anti extrusion protein MatE  42.01 
 
 		 459 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3623  MATE efflux family protein  40.56 
 
 		 457 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1675  MATE efflux family protein  41.81 
 
 		 457 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1888  MATE efflux family protein  38.96 
 
 		 457 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0796  multi anti extrusion protein MatE  38.75 
 
 		 484 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0908  multi anti extrusion protein MatE  37.33 
 
 		 483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0522974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5248  multi antimicrobial extrusion protein MatE  38.52 
 
 		 478 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0771  putative cation-driven multidrug efflux pump  39.51 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132131 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.31 
 
 		 460 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3218  multi anti extrusion protein MatE  36.52 
 
 		 455 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3060  multi anti extrusion protein MatE  36.52 
 
 		 456 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.9 
 
 		 454 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  31.07 
 
 		 484 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  29.78 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 445 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  30.6 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  29.95 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.11 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 452 aa  121  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 454 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.27 
 
 		 486 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  29.38 
 
 		 456 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  31.03 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.71 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 525 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 500 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 454 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 451 aa  116  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 470 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.63 
 
 		 485 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 459 aa  114  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  30.83 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 456 aa  103  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  30.83 
 
 		 486 aa  103  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  28 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  25.74 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  25.3 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  29 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 461 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.85 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  23.18 
 
 		 453 aa  99.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  23.08 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 443 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 475 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  29.98 
 
 		 492 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  30.26 
 
 		 490 aa  97.8  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 460 aa  97.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 454 aa  97.4  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 456 aa  96.7  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  23.02 
 
 		 469 aa  96.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  23.02 
 
 		 469 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  23.61 
 
 		 469 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  23.02 
 
 		 469 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  23.02 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  22.84 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 457 aa  95.9  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  31.91 
 
 		 503 aa  95.1  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>