More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7312 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  894    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 450 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  27.5 
 
 		 456 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  27.74 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  27.74 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  27.52 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.42 
 
 		 555 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  25.79 
 
 		 440 aa  159  8e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  24.14 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  25 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  23.29 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  25.34 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  24.72 
 
 		 439 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 486 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  25.57 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  25.23 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 461 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  25.51 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  22.75 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  22.72 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  21.99 
 
 		 470 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 464 aa  94  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 453 aa  89.7  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  25.42 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25 
 
 		 486 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.1 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  25.92 
 
 		 460 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.42 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  22.76 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  23.78 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  22.89 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  21.13 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  24.47 
 
 		 457 aa  76.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  23.56 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  21.38 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  22.43 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  25.97 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  20.14 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  21.46 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  21.9 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  27.22 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  27.22 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  21.37 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  24.77 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  21.6 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  20.81 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2403  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  22.9 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  21.1 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  22.12 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  22.82 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  21.1 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  21.88 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  21.88 
 
 		 495 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  21.88 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  23.35 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  21.88 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  22.49 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  21.9 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  21.39 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>