158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3810 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  475  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  70.76 
 
 		 261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  49.56 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  46.72 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  46.64 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  46.78 
 
 		 230 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  44.02 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  45.42 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  45.37 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  42.68 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  45.95 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  44.13 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  40.47 
 
 		 216 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  35.89 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  43.97 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  38.5 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  31.73 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  33.49 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  36.52 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  32.61 
 
 		 206 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 333 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 342 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 196 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 199 aa  45.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 206 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.04 
 
 		 205 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 192 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 191 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 237 aa  45.4  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  35.54 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>