More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2574 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 449 aa  909    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  46.56 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  50.25 
 
 		 456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  47.19 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  41.05 
 
 		 450 aa  350  3e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  42.12 
 
 		 447 aa  347  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  40.05 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 480 aa  276  7e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  36.49 
 
 		 449 aa  262  8e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  34.48 
 
 		 445 aa  259  6e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  33.99 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  32.74 
 
 		 437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  33.49 
 
 		 440 aa  203  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.96 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  28.76 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  31.3 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.97 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  31.44 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.59 
 
 		 431 aa  156  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 442 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.71 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  28.41 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  28.78 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 431 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  26.46 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 430 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.23 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 504 aa  93.2  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 446 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.65 
 
 		 426 aa  90.5  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  24.28 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.36 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 428 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.3 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4955  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 438 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 951 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  24.19 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.98 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  30.52 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.18 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.45 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>