118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1843 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 730 aa  1481    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  57.86 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  60.85 
 
 		 436 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  50.77 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  50 
 
 		 427 aa  369  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  45.69 
 
 		 449 aa  340  8e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  52.16 
 
 		 376 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  35.76 
 
 		 686 aa  303  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  44.58 
 
 		 427 aa  300  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  55.24 
 
 		 347 aa  300  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  51.75 
 
 		 627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  35.34 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  45.16 
 
 		 334 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  40.43 
 
 		 567 aa  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  45.05 
 
 		 487 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  43.61 
 
 		 794 aa  219  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  39.32 
 
 		 560 aa  211  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  38.29 
 
 		 504 aa  208  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  39.6 
 
 		 447 aa  200  7e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  35.52 
 
 		 498 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  33.77 
 
 		 385 aa  190  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  32.09 
 
 		 397 aa  187  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  35.86 
 
 		 380 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  37.79 
 
 		 326 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  34.57 
 
 		 346 aa  181  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  33.68 
 
 		 402 aa  178  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  32.8 
 
 		 405 aa  177  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  37.84 
 
 		 522 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  36.5 
 
 		 366 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  35.93 
 
 		 457 aa  163  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  29.65 
 
 		 392 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  34.47 
 
 		 391 aa  159  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  33.95 
 
 		 322 aa  158  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  34.23 
 
 		 368 aa  157  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  34.93 
 
 		 644 aa  157  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  32.84 
 
 		 366 aa  156  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  34.23 
 
 		 368 aa  156  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  33.33 
 
 		 345 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  36.22 
 
 		 439 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  35.11 
 
 		 361 aa  155  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  35.11 
 
 		 361 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  35.11 
 
 		 361 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  31.78 
 
 		 345 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  31.72 
 
 		 666 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  34.15 
 
 		 571 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  32.01 
 
 		 338 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  35.43 
 
 		 326 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  36.16 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  29.94 
 
 		 337 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  29.83 
 
 		 865 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  43.68 
 
 		 317 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  34.38 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  34.33 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  32.28 
 
 		 746 aa  109  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  33.82 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  30.86 
 
 		 434 aa  106  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  29.55 
 
 		 389 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  36.95 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  35.2 
 
 		 327 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.79 
 
 		 991 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  28.1 
 
 		 375 aa  95.5  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  31.25 
 
 		 365 aa  95.1  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  31.61 
 
 		 325 aa  95.1  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  28.85 
 
 		 462 aa  92.8  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  28.52 
 
 		 400 aa  90.5  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  28.29 
 
 		 400 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  29.13 
 
 		 427 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  28.8 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  28.8 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  28.8 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  28.8 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  30.62 
 
 		 922 aa  84  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  27.73 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  27.73 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  27.45 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  27.73 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  32.84 
 
 		 351 aa  83.2  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  30.55 
 
 		 554 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  32.83 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  27.45 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  27.45 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  27.45 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  27.45 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  27.45 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  27.43 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  28.57 
 
 		 594 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  27.87 
 
 		 427 aa  80.1  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  30.35 
 
 		 527 aa  79.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  28.64 
 
 		 1409 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  28.64 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  27.42 
 
 		 365 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  27.54 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  27.72 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  24.48 
 
 		 1316 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  28.74 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  27.22 
 
 		 769 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  38.05 
 
 		 374 aa  63.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  32.03 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  37.29 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  26.64 
 
 		 919 aa  60.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>