More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1886 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  100 
 
 		 417 aa  857    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  56.51 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  54.26 
 
 		 411 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  55.09 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  55.09 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  55.09 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  55.09 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  50.5 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  50.5 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  50.5 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  49.75 
 
 		 420 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  50.78 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  48.61 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  47.49 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  50.65 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  84.92 
 
 		 191 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  37.38 
 
 		 397 aa  219  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  36.69 
 
 		 566 aa  210  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  38.22 
 
 		 559 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  37.33 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  36.16 
 
 		 578 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  36.16 
 
 		 580 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  36.62 
 
 		 557 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  35.91 
 
 		 578 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  36.39 
 
 		 578 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  36.39 
 
 		 578 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  36.39 
 
 		 578 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  37.24 
 
 		 580 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  36.43 
 
 		 575 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  36.75 
 
 		 566 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  37.21 
 
 		 565 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  35.32 
 
 		 565 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  35.32 
 
 		 565 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  35.32 
 
 		 565 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  35.32 
 
 		 565 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  34.81 
 
 		 563 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  36.81 
 
 		 588 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  36.36 
 
 		 566 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  35.75 
 
 		 563 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  35.46 
 
 		 563 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  34.61 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  34.61 
 
 		 559 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  33.5 
 
 		 559 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  34.98 
 
 		 630 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  33.25 
 
 		 565 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  33.25 
 
 		 565 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  33.33 
 
 		 716 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  35.18 
 
 		 618 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  34.92 
 
 		 559 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  34.92 
 
 		 507 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  30.09 
 
 		 704 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  30.09 
 
 		 704 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  32.8 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  36.54 
 
 		 770 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  34.65 
 
 		 733 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  30.55 
 
 		 408 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  30.55 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  31.63 
 
 		 710 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  28.65 
 
 		 376 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  29.79 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  34.02 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  29.52 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1318  integrase/recombinase protein  48.94 
 
 		 190 aa  133  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  29.93 
 
 		 797 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  29.36 
 
 		 624 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  33.33 
 
 		 508 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.02 
 
 		 616 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  27.19 
 
 		 732 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  28.91 
 
 		 618 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  27.29 
 
 		 734 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  32.28 
 
 		 577 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  32.28 
 
 		 577 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  28.69 
 
 		 609 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  33.82 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 609 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  27.51 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  25.69 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  26.65 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  43.06 
 
 		 222 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  28.19 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  28.94 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  26.88 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  31.52 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  30.97 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  31.03 
 
 		 495 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  26.39 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  24.06 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  28.94 
 
 		 495 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.36 
 
 		 299 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  25.26 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  27.82 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.23 
 
 		 310 aa  91.3  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  25 
 
 		 430 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  28.81 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.76 
 
 		 301 aa  90.5  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  24.54 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  24.54 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.06 
 
 		 299 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>