148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0757 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002720  chitinase  64.03 
 
 		 848 aa  1140    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  100 
 
 		 846 aa  1722    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  64.57 
 
 		 846 aa  1161    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  64.18 
 
 		 846 aa  1147    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  70.13 
 
 		 543 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  35.18 
 
 		 680 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  34.71 
 
 		 1362 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  40.91 
 
 		 360 aa  209  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  40.91 
 
 		 360 aa  209  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  40.91 
 
 		 360 aa  209  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  39.76 
 
 		 360 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 		 360 aa  201  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  39.71 
 
 		 360 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  40.91 
 
 		 360 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  34.65 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  40.18 
 
 		 360 aa  196  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  40.61 
 
 		 360 aa  195  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  34.03 
 
 		 1152 aa  191  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  37.35 
 
 		 376 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  31.81 
 
 		 648 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  29.87 
 
 		 1578 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  33.64 
 
 		 510 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  33.02 
 
 		 420 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  38.69 
 
 		 1051 aa  171  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  30.57 
 
 		 962 aa  171  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  33.96 
 
 		 341 aa  167  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  33.33 
 
 		 468 aa  158  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  32.71 
 
 		 613 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 1127 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  30.43 
 
 		 1285 aa  147  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  32.96 
 
 		 1127 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  33.02 
 
 		 467 aa  140  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  31.16 
 
 		 1054 aa  140  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  33.61 
 
 		 1127 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  33.59 
 
 		 1053 aa  140  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  33.61 
 
 		 1127 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  32.68 
 
 		 460 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  32.95 
 
 		 1129 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  29.33 
 
 		 492 aa  120  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  29.65 
 
 		 471 aa  119  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1406 aa  118  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  29.82 
 
 		 565 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  28.81 
 
 		 729 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  28.81 
 
 		 729 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  29.02 
 
 		 471 aa  115  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  39.78 
 
 		 1146 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  33.01 
 
 		 1123 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  30.09 
 
 		 483 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 727 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  29.85 
 
 		 483 aa  111  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  29.85 
 
 		 516 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  30.74 
 
 		 703 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  27.13 
 
 		 699 aa  107  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 		 484 aa  101  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  27.99 
 
 		 1219 aa  101  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  43.29 
 
 		 174 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  26.04 
 
 		 598 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  29.88 
 
 		 1047 aa  98.6  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  27.46 
 
 		 353 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  41.3 
 
 		 189 aa  97.4  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  28.11 
 
 		 782 aa  97.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.68 
 
 		 551 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  41.18 
 
 		 245 aa  96.3  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  27.27 
 
 		 803 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  28.01 
 
 		 782 aa  92  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1452 aa  87.4  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  35.11 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  27 
 
 		 816 aa  83.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 		 1224 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  30.16 
 
 		 1059 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  28.39 
 
 		 1096 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0591  putative chitinase  30.38 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  38.13 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  22.86 
 
 		 14944 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.16 
 
 		 984 aa  75.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  38.73 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  24.5 
 
 		 1057 aa  74.3  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  35.68 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  42.86 
 
 		 540 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  38.32 
 
 		 692 aa  72.4  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  24.84 
 
 		 12684 aa  71.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.18 
 
 		 1143 aa  70.1  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1204 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  44.83 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.9 
 
 		 979 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  44.59 
 
 		 1132 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  27.45 
 
 		 1113 aa  64.3  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  39.18 
 
 		 550 aa  64.3  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  41.3 
 
 		 491 aa  63.9  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  40.98 
 
 		 1113 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  43.37 
 
 		 974 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  33.71 
 
 		 827 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  32 
 
 		 1141 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.26 
 
 		 915 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  31.62 
 
 		 1275 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  32 
 
 		 1444 aa  59.3  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  46.15 
 
 		 1585 aa  59.3  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  46.15 
 
 		 1217 aa  58.9  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  45.83 
 
 		 1247 aa  58.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  36.26 
 
 		 991 aa  57.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>