More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0855 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  42.07 
 
 		 1192 aa  741    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  77.28 
 
 		 1201 aa  1657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1200 aa  2346    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  47.65 
 
 		 1189 aa  870    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  32.78 
 
 		 1187 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  31.85 
 
 		 1190 aa  546  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.06 
 
 		 1196 aa  535  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  31.05 
 
 		 1189 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  31.05 
 
 		 1189 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  32.72 
 
 		 1181 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  31.25 
 
 		 1189 aa  533  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  31.2 
 
 		 1189 aa  529  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  31.05 
 
 		 1189 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  30.99 
 
 		 1189 aa  528  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  31.05 
 
 		 1189 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  31.2 
 
 		 1189 aa  529  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  31.63 
 
 		 1189 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  35.09 
 
 		 1187 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  31.03 
 
 		 1189 aa  526  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  30.8 
 
 		 1189 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  33.39 
 
 		 1198 aa  515  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 		 1188 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  31.26 
 
 		 1186 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 		 1188 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  30.05 
 
 		 1190 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  30.58 
 
 		 1189 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  28.46 
 
 		 1185 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.19 
 
 		 1187 aa  485  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  29.95 
 
 		 1186 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.8 
 
 		 1185 aa  473  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  27.39 
 
 		 1177 aa  466  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.79 
 
 		 1174 aa  452  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  30.56 
 
 		 1177 aa  450  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  28.31 
 
 		 1191 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.07 
 
 		 1184 aa  437  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  30.97 
 
 		 1176 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1199 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1199 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  31.88 
 
 		 1177 aa  429  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.43 
 
 		 1175 aa  425  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  28.77 
 
 		 1176 aa  425  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  32.21 
 
 		 1173 aa  423  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.42 
 
 		 1177 aa  412  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.52 
 
 		 1185 aa  396  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  26.89 
 
 		 1148 aa  396  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  28.91 
 
 		 1186 aa  389  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  30.49 
 
 		 1162 aa  386  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  28.75 
 
 		 1168 aa  383  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.93 
 
 		 1178 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.72 
 
 		 1170 aa  380  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  30.53 
 
 		 1167 aa  376  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.09 
 
 		 1170 aa  375  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  28.03 
 
 		 1179 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  30.09 
 
 		 1162 aa  373  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  30.7 
 
 		 1162 aa  370  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  26.41 
 
 		 1169 aa  364  6e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  29.44 
 
 		 1162 aa  364  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  30.02 
 
 		 1168 aa  363  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  26.45 
 
 		 1169 aa  362  2e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.24 
 
 		 1180 aa  360  7e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  30.3 
 
 		 1167 aa  360  8e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  30.22 
 
 		 1167 aa  358  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 		 1167 aa  358  3.9999999999999996e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.22 
 
 		 1164 aa  356  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.81 
 
 		 1175 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  28.38 
 
 		 1174 aa  352  2e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  29.2 
 
 		 1179 aa  349  2e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.4 
 
 		 1174 aa  345  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  30.71 
 
 		 1175 aa  343  8e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  26.18 
 
 		 1184 aa  337  5.999999999999999e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  30.08 
 
 		 1134 aa  335  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  29.6 
 
 		 1171 aa  335  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  28.86 
 
 		 1198 aa  335  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  30.78 
 
 		 1181 aa  333  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  29.46 
 
 		 1165 aa  331  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  30.8 
 
 		 1175 aa  331  6e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1164 aa  330  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  29.69 
 
 		 1174 aa  328  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 		 1190 aa  327  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  24.05 
 
 		 1153 aa  325  3e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  31.39 
 
 		 1191 aa  304  6.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  24.24 
 
 		 1189 aa  301  5e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  23.68 
 
 		 1189 aa  301  5e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  23.68 
 
 		 1189 aa  300  1e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.8 
 
 		 1199 aa  295  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  27.79 
 
 		 1308 aa  287  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  25.73 
 
 		 1174 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  24.15 
 
 		 1172 aa  286  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  25.45 
 
 		 1219 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  34.37 
 
 		 1187 aa  277  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  23.44 
 
 		 1191 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  28.19 
 
 		 1171 aa  271  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 		 1217 aa  271  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.82 
 
 		 1175 aa  269  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  27.61 
 
 		 1193 aa  262  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 		 1190 aa  259  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  33.66 
 
 		 1185 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  26.12 
 
 		 1198 aa  254  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  27.2 
 
 		 1172 aa  240  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  22.4 
 
 		 1196 aa  239  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>