283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4407 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 562 aa  1105    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  29 
 
 		 645 aa  114  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  27.99 
 
 		 614 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  29.03 
 
 		 637 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.88 
 
 		 601 aa  97.1  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  26.9 
 
 		 739 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  27.75 
 
 		 648 aa  95.9  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 563 aa  93.6  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 305 aa  90.9  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  23.4 
 
 		 740 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  26.38 
 
 		 627 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  29.51 
 
 		 520 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  26.09 
 
 		 705 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  35.9 
 
 		 647 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  30.86 
 
 		 518 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  26.85 
 
 		 665 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  29.17 
 
 		 555 aa  77  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  27.65 
 
 		 618 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  27.85 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  27.85 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  27.85 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  32.18 
 
 		 538 aa  74.7  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  27.85 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  27.85 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  27.85 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  27.7 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  31.43 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  31.87 
 
 		 616 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  32.74 
 
 		 399 aa  72  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  26.35 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  30.97 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  29.44 
 
 		 600 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  32.87 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  28.99 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  23.77 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  34.97 
 
 		 520 aa  67  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 552 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  27.07 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 516 aa  65.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  30.53 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  48.61 
 
 		 557 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  45.33 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  39.74 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  34.85 
 
 		 609 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  25.65 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  37.07 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  38.84 
 
 		 501 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 558 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  30.46 
 
 		 525 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  41.18 
 
 		 561 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  24.44 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  34.85 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 597 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  32 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  25.9 
 
 		 616 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  42.86 
 
 		 554 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  42.86 
 
 		 554 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  42.86 
 
 		 554 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0495  CdaR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 645 aa  61.6  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  23.36 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  39 
 
 		 539 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  31.21 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  33.55 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  25.6 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  31.22 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.84 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  27.86 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  32.43 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  41.98 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  31.03 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  30.56 
 
 		 585 aa  58.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 639 aa  57.4  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  31.71 
 
 		 364 aa  57  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  43.66 
 
 		 540 aa  57  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  43.94 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 494 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  23.4 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  23.4 
 
 		 387 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  36.9 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0676  hypothetical protein  39.22 
 
 		 170 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  23.81 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  23.4 
 
 		 387 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  24.84 
 
 		 553 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  39.29 
 
 		 397 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  23.4 
 
 		 387 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  43.59 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  32.08 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  46.88 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.92 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>