283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0698 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  100 
 
 
586 aa  1173    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  44.08 
 
 
940 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  39.74 
 
 
771 aa  264  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  49.8 
 
 
747 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  47.27 
 
 
408 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  41.25 
 
 
1096 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  52 
 
 
635 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  42.04 
 
 
405 aa  176  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  47.3 
 
 
861 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  29.8 
 
 
2552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  36.68 
 
 
525 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  51.55 
 
 
656 aa  156  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  42.11 
 
 
373 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  40.34 
 
 
656 aa  152  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  40.32 
 
 
1862 aa  147  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  37.55 
 
 
2000 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  37.94 
 
 
713 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  38.87 
 
 
2554 aa  141  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  37.98 
 
 
930 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  38.1 
 
 
1732 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  34.44 
 
 
2122 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  37.89 
 
 
1120 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  37.04 
 
 
1682 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  35.94 
 
 
679 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  34.98 
 
 
528 aa  136  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  37.65 
 
 
1300 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  37.45 
 
 
1356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  35.48 
 
 
1094 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  36.27 
 
 
675 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  35.94 
 
 
669 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  37.13 
 
 
1842 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  36.19 
 
 
575 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.9 
 
 
735 aa  134  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  38.17 
 
 
1882 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  45.75 
 
 
926 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  35.29 
 
 
1667 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  45.1 
 
 
631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  36.31 
 
 
978 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  37.79 
 
 
2272 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  38.46 
 
 
2036 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  36.84 
 
 
3295 aa  131  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  37.02 
 
 
658 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  34.09 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  37.6 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  36.58 
 
 
752 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  35.02 
 
 
1361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  36.29 
 
 
1969 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  35.57 
 
 
561 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  36.33 
 
 
1241 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  33.46 
 
 
859 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.29 
 
 
910 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  35.55 
 
 
685 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  36.19 
 
 
581 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.71 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  34.41 
 
 
418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  34.78 
 
 
1528 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  31.03 
 
 
1282 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  35.83 
 
 
840 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  35.47 
 
 
963 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.18 
 
 
845 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  31.79 
 
 
941 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  35.51 
 
 
530 aa  115  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  31.72 
 
 
551 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  33.96 
 
 
719 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  36.57 
 
 
525 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  43.71 
 
 
960 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  33.98 
 
 
791 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  35.29 
 
 
823 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  38.28 
 
 
1236 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  34.39 
 
 
870 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  44.44 
 
 
819 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  35.34 
 
 
819 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  34.63 
 
 
958 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  33.09 
 
 
1095 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  43.14 
 
 
184 aa  107  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  43.31 
 
 
838 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  37.21 
 
 
1387 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  32.38 
 
 
786 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  32.81 
 
 
802 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  41.97 
 
 
519 aa  104  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  34.39 
 
 
615 aa  104  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  35.36 
 
 
971 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  37.3 
 
 
1931 aa  100  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  43.04 
 
 
560 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  37.63 
 
 
644 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  42.95 
 
 
1001 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  33.81 
 
 
929 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  39.26 
 
 
443 aa  97.8  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  38.41 
 
 
439 aa  97.1  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.18 
 
 
869 aa  96.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  36.04 
 
 
1189 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  34.86 
 
 
1667 aa  95.9  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  41.83 
 
 
500 aa  95.1  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  32.73 
 
 
938 aa  94  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  33.73 
 
 
777 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  33.77 
 
 
1021 aa  92.8  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  34.48 
 
 
435 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  36.12 
 
 
1011 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  40.46 
 
 
168 aa  91.3  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  38.32 
 
 
400 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>