More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4678 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  36.79 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  32.04 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  35.05 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  31.02 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  36.51 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  35.95 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2241  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7288  hitchhiker  0.000000000000408452 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.34 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  21.84 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.34 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.34 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.34 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.34 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  31.52 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  31.52 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  31.52 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  30.21 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 310 aa  48.5  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 249 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.52 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  40 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  31.52 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>