161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2394 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
651 aa  1315    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  42.44 
 
 
703 aa  476  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  44.4 
 
 
768 aa  431  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  40.77 
 
 
1221 aa  335  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  37.79 
 
 
1004 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  34.47 
 
 
626 aa  233  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  36.41 
 
 
481 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  50.2 
 
 
1050 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  50.6 
 
 
984 aa  216  8e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  47.49 
 
 
748 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  28.67 
 
 
717 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2389  hypothetical protein  55.7 
 
 
507 aa  156  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.573673  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2400  hypothetical protein  49.65 
 
 
611 aa  127  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150385  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  24.13 
 
 
358 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
365 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  26.44 
 
 
755 aa  87.4  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  50 
 
 
831 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  27.18 
 
 
930 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  26.27 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  57.45 
 
 
762 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  24.05 
 
 
459 aa  79  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.18 
 
 
795 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  24.25 
 
 
1194 aa  77.8  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  26.04 
 
 
505 aa  77.4  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  27.16 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  25.82 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  45.92 
 
 
617 aa  73.9  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  26.16 
 
 
608 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  26.29 
 
 
505 aa  72.8  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  22.65 
 
 
566 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  22.43 
 
 
1302 aa  71.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  25.69 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  26.1 
 
 
610 aa  71.2  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 
709 aa  70.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  24.71 
 
 
638 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  23.42 
 
 
462 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  22.73 
 
 
748 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  45.26 
 
 
880 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  30.86 
 
 
235 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  26.48 
 
 
457 aa  65.1  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 
658 aa  64.7  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  35.43 
 
 
1154 aa  63.9  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  41.84 
 
 
552 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  24.35 
 
 
346 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  36.04 
 
 
1887 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  41.75 
 
 
703 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  24.18 
 
 
525 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  24.71 
 
 
630 aa  62  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  44.94 
 
 
1121 aa  62.4  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  32.19 
 
 
637 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40.8 
 
 
743 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  40.3 
 
 
561 aa  62  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  45.05 
 
 
1137 aa  61.2  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  45.74 
 
 
2334 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  51.22 
 
 
1017 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  22.48 
 
 
426 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  25.22 
 
 
378 aa  59.3  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  24.42 
 
 
322 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  36.84 
 
 
503 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  44.19 
 
 
1209 aa  58.5  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  38.3 
 
 
614 aa  57.4  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  33.61 
 
 
655 aa  57  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  37.89 
 
 
455 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  37.89 
 
 
455 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  24.56 
 
 
1167 aa  57  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  38.68 
 
 
938 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.45 
 
 
1448 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  41.98 
 
 
544 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  36.89 
 
 
854 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.53 
 
 
729 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  38.71 
 
 
459 aa  55.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  38.74 
 
 
680 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  44.05 
 
 
649 aa  54.7  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  42.7 
 
 
973 aa  54.3  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  37.5 
 
 
456 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  37.89 
 
 
455 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  41.3 
 
 
1200 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.29 
 
 
6885 aa  53.9  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.86 
 
 
809 aa  53.9  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  31.9 
 
 
464 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  37.89 
 
 
455 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  36.84 
 
 
455 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  36.56 
 
 
870 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  36.84 
 
 
456 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  39.18 
 
 
1213 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  36.84 
 
 
455 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  32.98 
 
 
674 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  35.79 
 
 
455 aa  52.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  32.98 
 
 
674 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 
1462 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  35.05 
 
 
465 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  34.51 
 
 
458 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  35.79 
 
 
455 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  32.98 
 
 
674 aa  52  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  32.98 
 
 
674 aa  52  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  32.98 
 
 
674 aa  52  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  38.3 
 
 
667 aa  52  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  36.84 
 
 
455 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  38.2 
 
 
685 aa  51.6  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  32.98 
 
 
674 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>