More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2277 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  31.73 
 
 
1885 aa  656    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  29.96 
 
 
2361 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.01 
 
 
1780 aa  805    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
1942 aa  738    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.22 
 
 
1901 aa  701    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.25 
 
 
1805 aa  722    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  30.59 
 
 
1934 aa  678    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.69 
 
 
1804 aa  745    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.08 
 
 
1794 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  28.67 
 
 
1850 aa  745    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.26 
 
 
1797 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.2 
 
 
1795 aa  723    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.28 
 
 
1808 aa  796    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 
1914 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
1908 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  29.9 
 
 
1805 aa  783    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
1932 aa  770    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  100 
 
 
1797 aa  3620    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  30.79 
 
 
1922 aa  684    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  31.29 
 
 
2051 aa  832    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  29.62 
 
 
2077 aa  710    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.26 
 
 
2017 aa  636  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.1 
 
 
1774 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  31.2 
 
 
1809 aa  620  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  26.61 
 
 
1811 aa  613  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.08 
 
 
1822 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  30.53 
 
 
1833 aa  601  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  31.39 
 
 
1837 aa  596  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.96 
 
 
1845 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.6 
 
 
1780 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  27.18 
 
 
2272 aa  553  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  27.69 
 
 
2279 aa  551  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  27.38 
 
 
1871 aa  544  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.64 
 
 
1668 aa  538  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  28.51 
 
 
2303 aa  528  1e-148  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
1644 aa  526  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.73 
 
 
1663 aa  516  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  26.85 
 
 
1712 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.96 
 
 
2109 aa  498  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  27.37 
 
 
1697 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  28.23 
 
 
1836 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 
670 aa  463  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  25.31 
 
 
1739 aa  426  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  29.35 
 
 
1788 aa  412  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  27.05 
 
 
1710 aa  365  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  26.39 
 
 
1756 aa  350  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  26.11 
 
 
1744 aa  347  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 
1637 aa  338  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  25 
 
 
1685 aa  330  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 
1636 aa  327  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  25.18 
 
 
1682 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.11 
 
 
1682 aa  308  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 
1629 aa  302  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 
1123 aa  283  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 
1643 aa  273  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.25 
 
 
1885 aa  271  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  26.06 
 
 
1064 aa  270  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 
1649 aa  255  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  31.86 
 
 
1685 aa  252  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  31.61 
 
 
1685 aa  249  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  24.79 
 
 
1112 aa  242  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
1726 aa  237  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  25.58 
 
 
1060 aa  225  6e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.08 
 
 
1748 aa  223  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.9 
 
 
1832 aa  212  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  25.94 
 
 
1473 aa  206  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  25.96 
 
 
1473 aa  204  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  25.96 
 
 
1473 aa  204  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  26.33 
 
 
1123 aa  196  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  26.86 
 
 
1774 aa  189  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
407 aa  160  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  23.84 
 
 
2312 aa  156  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  32.7 
 
 
667 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  31.61 
 
 
454 aa  155  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 
1235 aa  152  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  34.08 
 
 
475 aa  151  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  33.33 
 
 
1414 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
673 aa  147  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  32.49 
 
 
448 aa  140  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5226  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
388 aa  140  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
389 aa  139  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
387 aa  135  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.53 
 
 
1274 aa  134  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  31.33 
 
 
560 aa  134  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1613  histidine kinase  31.65 
 
 
594 aa  133  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000260533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 
700 aa  132  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  35.46 
 
 
588 aa  131  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
560 aa  130  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  34.43 
 
 
661 aa  129  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
906 aa  128  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  23.68 
 
 
900 aa  128  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
844 aa  128  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  34.29 
 
 
537 aa  127  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
695 aa  127  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
494 aa  127  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.97 
 
 
579 aa  126  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 
1820 aa  125  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  29.18 
 
 
968 aa  125  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  33.76 
 
 
737 aa  125  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2539  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
554 aa  125  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.787523  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>