193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6252 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  100 
 
 
737 aa  1492  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  52.01 
 
 
589 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  46.74 
 
 
583 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  45.5 
 
 
441 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  41.94 
 
 
612 aa  295  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.26 
 
 
445 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  31.22 
 
 
433 aa  186  1e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  31.58 
 
 
604 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  30.48 
 
 
471 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  30.7 
 
 
446 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  29.19 
 
 
547 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  29.27 
 
 
450 aa  165  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  28.34 
 
 
535 aa  164  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  28.34 
 
 
407 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  28.03 
 
 
408 aa  162  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  32.74 
 
 
587 aa  161  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  29.72 
 
 
533 aa  160  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  29.84 
 
 
535 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  28.28 
 
 
535 aa  154  6e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  1.86405e-06 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  28.01 
 
 
548 aa  153  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  28.64 
 
 
532 aa  149  1e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  26.67 
 
 
558 aa  149  2e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  29.41 
 
 
427 aa  146  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  27.13 
 
 
658 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  28.7 
 
 
445 aa  144  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  28.57 
 
 
424 aa  141  4e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  26.16 
 
 
568 aa  139  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  27.87 
 
 
453 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  28.64 
 
 
387 aa  138  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  28.48 
 
 
442 aa  137  7e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  31.87 
 
 
963 aa  136  2e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  27.15 
 
 
403 aa  135  4e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  26.84 
 
 
411 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  27.29 
 
 
574 aa  133  1e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  25.39 
 
 
677 aa  133  1e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  26.3 
 
 
399 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  6.54104e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  26.02 
 
 
567 aa  130  7e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  27.98 
 
 
440 aa  127  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  27.53 
 
 
693 aa  125  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  25.16 
 
 
408 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  1.5241e-12  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  26.23 
 
 
597 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  28.83 
 
 
727 aa  123  1e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  26 
 
 
435 aa  120  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  2.26064e-06  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  29.13 
 
 
469 aa  117  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  27.95 
 
 
850 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  25.29 
 
 
541 aa  110  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  33.45 
 
 
806 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  33.45 
 
 
806 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  33.45 
 
 
806 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  33.45 
 
 
806 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  33.45 
 
 
806 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.45 
 
 
806 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  33.45 
 
 
806 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  32.27 
 
 
806 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  28.4 
 
 
413 aa  101  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  37.59 
 
 
691 aa  100  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  23.94 
 
 
640 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  38.52 
 
 
412 aa  97.4  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  25.18 
 
 
672 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  40.41 
 
 
510 aa  94.4  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  42.75 
 
 
495 aa  93.2  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  35.21 
 
 
571 aa  91.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  36.81 
 
 
771 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  22.05 
 
 
1172 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  36.18 
 
 
494 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  23.67 
 
 
636 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.68 
 
 
507 aa  89  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  37.59 
 
 
401 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  23.78 
 
 
469 aa  88.2  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.94 
 
 
474 aa  87.8  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  34.29 
 
 
411 aa  87.8  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.82 
 
 
507 aa  87.8  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.08 
 
 
476 aa  86.7  1e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  8.57688e-05  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  26.96 
 
 
938 aa  85.9  2e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  34.33 
 
 
537 aa  85.9  2e-15  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  36.57 
 
 
566 aa  85.5  3e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.81 
 
 
514 aa  85.9  3e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  34.27 
 
 
943 aa  85.5  3e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.33 
 
 
507 aa  85.5  3e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  33.81 
 
 
503 aa  85.1  4e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  35.29 
 
 
230 aa  84.7  5e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  34.33 
 
 
897 aa  84.7  6e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  37.04 
 
 
1016 aa  84.7  6e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  35.25 
 
 
472 aa  82.8  2e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.94163e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.51 
 
 
436 aa  81.6  4e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  30.22 
 
 
503 aa  80.9  8e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.91 
 
 
520 aa  80.5  1e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  35.21 
 
 
582 aa  79.7  2e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  29.02 
 
 
493 aa  79.7  2e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.76 
 
 
466 aa  77.4  8e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  35.77 
 
 
491 aa  77.4  8e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  33.33 
 
 
664 aa  76.3  2e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  29.06 
 
 
392 aa  75.5  4e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  28.89 
 
 
748 aa  75.5  4e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.17 
 
 
507 aa  74.7  5e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  31.58 
 
 
497 aa  74.3  7e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  33.77 
 
 
1259 aa  74.3  8e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  33.33 
 
 
430 aa  74.3  8e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  34.04 
 
 
1139 aa  73.9  1e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  33.33 
 
 
1413 aa  73.6  1e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>