91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3292 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 488 aa  976    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  47.93 
 
 		 804 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  54.55 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  48.79 
 
 		 707 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  47.82 
 
 		 789 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  49.23 
 
 		 703 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  49.13 
 
 		 476 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  48.25 
 
 		 475 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.33 
 
 		 810 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  43.59 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  43.42 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  43.87 
 
 		 1112 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  44.52 
 
 		 1121 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  44.09 
 
 		 1121 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  43.44 
 
 		 1121 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  39.92 
 
 		 1143 aa  340  5e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  35.66 
 
 		 848 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  38.81 
 
 		 1174 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  26.8 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  28.11 
 
 		 531 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  29.35 
 
 		 581 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  28.93 
 
 		 456 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.54 
 
 		 343 aa  97.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  28.9 
 
 		 331 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.93 
 
 		 355 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.21 
 
 		 356 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.21 
 
 		 355 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.89 
 
 		 357 aa  90.5  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.97 
 
 		 319 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.37 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.94 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  30.23 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.76 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.8 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.38 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.94 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  35.6 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  31.68 
 
 		 598 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.92 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  27.54 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  29.75 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.61 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  23.04 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  27.31 
 
 		 829 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  26.71 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.32 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  25.44 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  27.62 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  25.61 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  27.14 
 
 		 522 aa  57  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  27.38 
 
 		 524 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  25.56 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.69 
 
 		 522 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  24.79 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.05 
 
 		 366 aa  55.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  27.66 
 
 		 357 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 		 345 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.62 
 
 		 536 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  28.31 
 
 		 334 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25.1 
 
 		 323 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  26.15 
 
 		 522 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 		 304 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  26.95 
 
 		 456 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.52 
 
 		 315 aa  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  23.6 
 
 		 324 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  22.74 
 
 		 501 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  24.51 
 
 		 480 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  23.95 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  25.11 
 
 		 313 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  29.02 
 
 		 699 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  27.19 
 
 		 527 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.21 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  25.35 
 
 		 563 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  25.29 
 
 		 383 aa  47  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  28.22 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  25.38 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 		 572 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  24.23 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.84 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 345 aa  44.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.76 
 
 		 384 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  23.59 
 
 		 495 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  22.67 
 
 		 644 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 		 492 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  26.19 
 
 		 533 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>