117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2173 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  100 
 
 		 590 aa  1168    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  96.95 
 
 		 888 aa  971    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  88.32 
 
 		 878 aa  926    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  100 
 
 		 590 aa  1168    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  99.83 
 
 		 590 aa  1165    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  100 
 
 		 590 aa  1168    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  100 
 
 		 590 aa  1168    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  54.75 
 
 		 559 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  51.93 
 
 		 577 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  52.1 
 
 		 577 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  36.05 
 
 		 564 aa  302  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  38.34 
 
 		 566 aa  283  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  36.3 
 
 		 556 aa  263  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  37.74 
 
 		 545 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  37.74 
 
 		 569 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  31.66 
 
 		 578 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  33.74 
 
 		 530 aa  214  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  36.38 
 
 		 560 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  30.86 
 
 		 554 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  32.43 
 
 		 551 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  25.82 
 
 		 568 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5031  PilN  28.79 
 
 		 561 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5437  type IV secretion pathway protein  28.23 
 
 		 561 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.357309  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  27.47 
 
 		 547 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  26.09 
 
 		 563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  26.09 
 
 		 563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3705  hypothetical protein  27.5 
 
 		 586 aa  125  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  27.8 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2725  Type II secretory pathway component PulD-like protein  29.96 
 
 		 566 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4759  hypothetical protein  23.96 
 
 		 596 aa  98.2  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  24.87 
 
 		 534 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  26.09 
 
 		 536 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.55 
 
 		 538 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  22.71 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  22.07 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  22.86 
 
 		 508 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7243  hypothetical protein  26.19 
 
 		 598 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.33 
 
 		 577 aa  73.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6294  hypothetical protein  23.11 
 
 		 600 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000464983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  24.51 
 
 		 625 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  24.03 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.18 
 
 		 567 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.68 
 
 		 561 aa  67  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.68 
 
 		 561 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.68 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  28.91 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.59 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.1 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  22.3 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  22.33 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.3 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.69 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4249  hypothetical protein  22.78 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  26.18 
 
 		 819 aa  63.9  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  25.58 
 
 		 539 aa  63.9  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  25.28 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4700  hypothetical protein  25.82 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.12 
 
 		 563 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  19.61 
 
 		 463 aa  62  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  23.81 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  23.21 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  23.21 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  24.63 
 
 		 546 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  24.91 
 
 		 544 aa  60.1  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.04 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.04 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0725  Type II secretory pathway component PulD-like  23.82 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0680594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  26.34 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  23.21 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  23.36 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.65 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.65 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  24.31 
 
 		 559 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  25.44 
 
 		 581 aa  55.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0356  toxin co-regulated pilus biosynthesis outer membrane protein C  20.35 
 
 		 489 aa  56.2  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.903554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  24.57 
 
 		 569 aa  56.2  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.67 
 
 		 830 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.79 
 
 		 874 aa  54.7  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5430  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.3 
 
 		 681 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128772  normal  0.061937 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4751  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.3 
 
 		 680 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4228  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.3 
 
 		 681 aa  54.3  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  23.31 
 
 		 693 aa  53.9  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  22.55 
 
 		 537 aa  53.5  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3512  Type III secretion system outer membrane pore YscC/HrcC  22.3 
 
 		 681 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4854  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.3 
 
 		 681 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  22.8 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3741  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.38 
 
 		 678 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452401  normal  0.0121623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  26.63 
 
 		 780 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  22.77 
 
 		 609 aa  50.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  24 
 
 		 833 aa  50.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.84 
 
 		 550 aa  50.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  24.53 
 
 		 473 aa  50.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 554 aa  50.4  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  23.77 
 
 		 751 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  21.74 
 
 		 614 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  24.75 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  23.93 
 
 		 527 aa  49.7  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  24.35 
 
 		 714 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>