27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4249 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4249  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  966    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  22.65 
 
 		 559 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  24.75 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  24.75 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  24.75 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  24.75 
 
 		 590 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  24.75 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  23.61 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  26.15 
 
 		 888 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  25.34 
 
 		 878 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4759  hypothetical protein  24.03 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  21.79 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6294  hypothetical protein  26.95 
 
 		 600 aa  57  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000464983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  23.59 
 
 		 568 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  21.59 
 
 		 566 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7243  hypothetical protein  24.48 
 
 		 598 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3705  hypothetical protein  22.31 
 
 		 586 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  22.72 
 
 		 536 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  19.47 
 
 		 560 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  25.7 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  21.45 
 
 		 630 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  22.41 
 
 		 556 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  21.52 
 
 		 636 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  21.18 
 
 		 530 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  24.52 
 
 		 540 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  20.38 
 
 		 547 aa  44.3  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  28.46 
 
 		 578 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>