96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3734 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  100 
 
 		 530 aa  1072    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  48.99 
 
 		 560 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  36.33 
 
 		 554 aa  323  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  36.38 
 
 		 564 aa  279  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  33.51 
 
 		 569 aa  276  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  33.93 
 
 		 545 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  37.31 
 
 		 559 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  34.55 
 
 		 888 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  34.55 
 
 		 590 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  34.55 
 
 		 590 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  34.55 
 
 		 590 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  34.55 
 
 		 590 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  34.55 
 
 		 590 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  36.16 
 
 		 878 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  30.73 
 
 		 578 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  30.07 
 
 		 568 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  33.25 
 
 		 577 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  32.84 
 
 		 577 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  28.6 
 
 		 566 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  33.59 
 
 		 556 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  29.34 
 
 		 551 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5031  PilN  26.7 
 
 		 561 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5437  type IV secretion pathway protein  24.78 
 
 		 561 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.357309  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  26.25 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  25.48 
 
 		 563 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  25.48 
 
 		 563 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  26.67 
 
 		 540 aa  107  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  25.41 
 
 		 534 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2725  Type II secretory pathway component PulD-like protein  29.96 
 
 		 566 aa  97.8  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  24.66 
 
 		 536 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3705  hypothetical protein  24.5 
 
 		 586 aa  82  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  21.87 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6294  hypothetical protein  25.75 
 
 		 600 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000464983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4759  hypothetical protein  24.1 
 
 		 596 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7243  hypothetical protein  26.74 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  25.6 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.18 
 
 		 538 aa  63.9  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  25.17 
 
 		 667 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.92 
 
 		 830 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  22.51 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.9 
 
 		 506 aa  56.6  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  29.45 
 
 		 609 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.34 
 
 		 572 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  23.26 
 
 		 506 aa  55.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  25.85 
 
 		 563 aa  54.3  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  22.03 
 
 		 470 aa  53.5  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  20.86 
 
 		 508 aa  53.5  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  24.81 
 
 		 801 aa  53.5  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  21.75 
 
 		 512 aa  53.5  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  22.61 
 
 		 569 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  23.86 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  23.86 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  23.86 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  23.86 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  23.86 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  21.55 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  21.55 
 
 		 470 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  25.27 
 
 		 803 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  22.61 
 
 		 554 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.78 
 
 		 556 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  25.98 
 
 		 486 aa  51.2  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  25.44 
 
 		 734 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  23.76 
 
 		 492 aa  50.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  26.69 
 
 		 789 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  25.2 
 
 		 776 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  23.87 
 
 		 413 aa  48.9  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.16 
 
 		 577 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  22.89 
 
 		 537 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  22.38 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  23.46 
 
 		 433 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.66 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4700  hypothetical protein  24.09 
 
 		 492 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  22.66 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  21.35 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  22.94 
 
 		 543 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  23.24 
 
 		 891 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  24.26 
 
 		 541 aa  45.4  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.67 
 
 		 558 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.99 
 
 		 574 aa  44.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  22.97 
 
 		 733 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.12 
 
 		 556 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  22.81 
 
 		 805 aa  44.3  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  27 
 
 		 546 aa  44.3  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  23.29 
 
 		 549 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2087  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.73 
 
 		 625 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2060  type III secretion system protein BsaO  24.73 
 
 		 625 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.462668  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0740  type III secretion system protein BsaO  24.73 
 
 		 625 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.513099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.12 
 
 		 561 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  25.2 
 
 		 745 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1544  type III secretion system protein BsaO  24.73 
 
 		 606 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2175  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.73 
 
 		 617 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  21.21 
 
 		 625 aa  43.5  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0586  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.73 
 
 		 339 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000694626  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.12 
 
 		 561 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.12 
 
 		 561 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>