113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0117 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  100 
 
 		 560 aa  1144    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  48.99 
 
 		 530 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  40.64 
 
 		 554 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  38.92 
 
 		 564 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  33.98 
 
 		 569 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  36.79 
 
 		 545 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  30.89 
 
 		 568 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  36.39 
 
 		 559 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  36.48 
 
 		 878 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  36.14 
 
 		 888 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  36.25 
 
 		 590 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  36.25 
 
 		 590 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  36.25 
 
 		 590 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  36.25 
 
 		 590 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  36.25 
 
 		 590 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  32.01 
 
 		 578 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  31.02 
 
 		 556 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  27.91 
 
 		 577 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  28.62 
 
 		 566 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  27.46 
 
 		 577 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  26.97 
 
 		 551 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  25.6 
 
 		 563 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  25.6 
 
 		 563 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5437  type IV secretion pathway protein  25.04 
 
 		 561 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.357309  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5031  PilN  24.83 
 
 		 561 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  28.79 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  22.39 
 
 		 547 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2725  Type II secretory pathway component PulD-like protein  25.05 
 
 		 566 aa  98.2  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4759  hypothetical protein  24.39 
 
 		 596 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  25.9 
 
 		 536 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  27.22 
 
 		 534 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.2 
 
 		 572 aa  81.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6294  hypothetical protein  23.41 
 
 		 600 aa  76.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000464983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.45 
 
 		 538 aa  69.3  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  21.2 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7243  hypothetical protein  21.71 
 
 		 598 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  22.32 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  24.3 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  23.8 
 
 		 581 aa  62.4  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  21.77 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  22.33 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.24 
 
 		 556 aa  60.5  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  22.31 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  23.15 
 
 		 560 aa  60.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  21.41 
 
 		 506 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  22.04 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.29 
 
 		 561 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.29 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.26 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.22 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  22.04 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.01 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.58 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.07 
 
 		 574 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3705  hypothetical protein  21.58 
 
 		 586 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  21.41 
 
 		 549 aa  55.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  20.97 
 
 		 559 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.05 
 
 		 567 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.05 
 
 		 556 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  23.69 
 
 		 559 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  24 
 
 		 609 aa  54.7  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.61 
 
 		 563 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  24.24 
 
 		 751 aa  54.3  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  22.64 
 
 		 508 aa  53.9  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  25.1 
 
 		 794 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  25.85 
 
 		 660 aa  53.5  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  24.46 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.13 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  22.22 
 
 		 554 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  25.35 
 
 		 745 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.83 
 
 		 577 aa  50.4  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  22.05 
 
 		 537 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  24.5 
 
 		 696 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  22.71 
 
 		 833 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  27.01 
 
 		 720 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  23.02 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  23.31 
 
 		 539 aa  48.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  19.96 
 
 		 559 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  22.37 
 
 		 426 aa  48.1  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  22.68 
 
 		 563 aa  47.8  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  22.33 
 
 		 492 aa  47.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  21.14 
 
 		 530 aa  47.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  23.45 
 
 		 460 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  21.68 
 
 		 482 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  21.68 
 
 		 482 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  21.68 
 
 		 482 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  21.68 
 
 		 482 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  21.68 
 
 		 482 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  21.68 
 
 		 482 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  21.11 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  22.19 
 
 		 868 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  23.13 
 
 		 667 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  24.17 
 
 		 460 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  22.83 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4249  hypothetical protein  18.7 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  24.36 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  26.38 
 
 		 819 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  23.84 
 
 		 460 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  20.9 
 
 		 585 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2087  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  23.27 
 
 		 625 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>