110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0657 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  99.15 
 
 		 590 aa  977    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  100 
 
 		 888 aa  1762    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  86.27 
 
 		 878 aa  1290    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  99.15 
 
 		 590 aa  977    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  99.32 
 
 		 590 aa  979    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  99.15 
 
 		 590 aa  977    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  99.15 
 
 		 590 aa  977    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  54.48 
 
 		 559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  50.92 
 
 		 577 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  52.1 
 
 		 577 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  35.58 
 
 		 564 aa  302  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  38.97 
 
 		 566 aa  282  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  39.52 
 
 		 556 aa  262  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  38.1 
 
 		 545 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  38.1 
 
 		 569 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  32.56 
 
 		 578 aa  228  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  36.55 
 
 		 560 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  34.47 
 
 		 530 aa  213  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  30.63 
 
 		 554 aa  202  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  32.5 
 
 		 551 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  25.86 
 
 		 568 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5031  PilN  28.87 
 
 		 561 aa  157  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5437  type IV secretion pathway protein  28.74 
 
 		 561 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.357309  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  27.47 
 
 		 547 aa  150  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  26.3 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  26.3 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3705  hypothetical protein  27.37 
 
 		 586 aa  120  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  28.27 
 
 		 540 aa  118  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2725  Type II secretory pathway component PulD-like protein  30.08 
 
 		 566 aa  114  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4759  hypothetical protein  24.61 
 
 		 596 aa  98.2  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  24.87 
 
 		 534 aa  90.5  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  26.09 
 
 		 536 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.81 
 
 		 538 aa  80.9  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  22.54 
 
 		 563 aa  78.6  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  22.07 
 
 		 506 aa  77  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7243  hypothetical protein  25 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  22.86 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6294  hypothetical protein  26.69 
 
 		 600 aa  71.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000464983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.75 
 
 		 577 aa  71.2  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.75 
 
 		 567 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  24.64 
 
 		 625 aa  66.6  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.59 
 
 		 572 aa  66.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.1 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.86 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.86 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.86 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  29.86 
 
 		 560 aa  65.1  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  23.97 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.3 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  26.2 
 
 		 819 aa  63.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.28 
 
 		 562 aa  63.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  25.58 
 
 		 539 aa  62  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  23.28 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  24.54 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.31 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4249  hypothetical protein  22.75 
 
 		 483 aa  60.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  25.28 
 
 		 530 aa  60.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  19.61 
 
 		 463 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  23.21 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4700  hypothetical protein  25.82 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  23.21 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.8 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  23.81 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  23.36 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.04 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  26.34 
 
 		 561 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  22.45 
 
 		 470 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  24.91 
 
 		 544 aa  57.4  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0725  Type II secretory pathway component PulD-like  24.3 
 
 		 488 aa  56.6  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0680594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.65 
 
 		 559 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  24.31 
 
 		 559 aa  56.2  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.65 
 
 		 559 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5430  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.66 
 
 		 681 aa  55.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128772  normal  0.061937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  25.08 
 
 		 581 aa  55.5  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4751  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.3 
 
 		 680 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4228  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.3 
 
 		 681 aa  55.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3512  Type III secretion system outer membrane pore YscC/HrcC  22.3 
 
 		 681 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4854  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.3 
 
 		 681 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  23.87 
 
 		 537 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25 
 
 		 830 aa  53.9  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  26.78 
 
 		 541 aa  53.9  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0356  toxin co-regulated pilus biosynthesis outer membrane protein C  20.35 
 
 		 489 aa  53.5  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.903554  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3741  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  22.38 
 
 		 678 aa  53.5  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452401  normal  0.0121623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  24.06 
 
 		 569 aa  53.5  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  23.99 
 
 		 833 aa  51.6  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  26.58 
 
 		 547 aa  51.6  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  25.46 
 
 		 473 aa  51.6  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  26.63 
 
 		 780 aa  51.2  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  22.88 
 
 		 433 aa  51.2  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  23.66 
 
 		 693 aa  51.2  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.79 
 
 		 874 aa  50.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  21.74 
 
 		 614 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  23.28 
 
 		 609 aa  50.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  23.86 
 
 		 554 aa  50.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.37 
 
 		 550 aa  49.3  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  23.53 
 
 		 714 aa  48.9  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  22.26 
 
 		 585 aa  48.5  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  23.78 
 
 		 527 aa  48.5  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>