64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4203 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  100 
 
 		 547 aa  1115    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  27.23 
 
 		 888 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  26.99 
 
 		 590 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  26.99 
 
 		 590 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  26.99 
 
 		 590 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  26.99 
 
 		 590 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  26.99 
 
 		 590 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  26.76 
 
 		 878 aa  146  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  29.01 
 
 		 551 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  26.8 
 
 		 559 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  24.04 
 
 		 578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  27.69 
 
 		 564 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  22.98 
 
 		 577 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  22.47 
 
 		 577 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  25.19 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  25.33 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  23.32 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.48 
 
 		 569 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  23.65 
 
 		 556 aa  104  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  22.4 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  23.96 
 
 		 545 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  21.33 
 
 		 568 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5031  PilN  24.84 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5437  type IV secretion pathway protein  24.84 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.357309  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  22.39 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0356  toxin co-regulated pilus biosynthesis outer membrane protein C  21.97 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.903554  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6294  hypothetical protein  22.88 
 
 		 600 aa  63.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000464983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  24.45 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  24.45 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4759  hypothetical protein  20.55 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2725  Type II secretory pathway component PulD-like protein  20.77 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  26.16 
 
 		 683 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4249  hypothetical protein  21.62 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3705  hypothetical protein  22.56 
 
 		 586 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  22.15 
 
 		 536 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  23.7 
 
 		 812 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.73 
 
 		 684 aa  50.4  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  25.41 
 
 		 683 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  25.41 
 
 		 683 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  25.41 
 
 		 683 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  23.66 
 
 		 987 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  25.41 
 
 		 683 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  25.73 
 
 		 684 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  24.83 
 
 		 688 aa  47.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  25.73 
 
 		 684 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  23.86 
 
 		 682 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  23.55 
 
 		 413 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  21.52 
 
 		 609 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  25.89 
 
 		 683 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.42 
 
 		 538 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  25.41 
 
 		 684 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4700  hypothetical protein  25.23 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  22.66 
 
 		 657 aa  46.2  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.25 
 
 		 685 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  23.55 
 
 		 412 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  23.55 
 
 		 412 aa  44.3  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  24.32 
 
 		 412 aa  44.3  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  23.55 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  24.32 
 
 		 386 aa  43.9  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  23.55 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  21.23 
 
 		 534 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  24.32 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  23.55 
 
 		 412 aa  43.9  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  22.19 
 
 		 543 aa  43.5  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>