38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2725 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2725  Type II secretory pathway component PulD-like protein  100 
 
 		 566 aa  1135    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  26.51 
 
 		 559 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  30.08 
 
 		 888 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  30.08 
 
 		 590 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  30.08 
 
 		 590 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  30.08 
 
 		 590 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  30.08 
 
 		 590 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  30.08 
 
 		 590 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  28.46 
 
 		 878 aa  114  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  24.03 
 
 		 577 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  26.33 
 
 		 564 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  24.69 
 
 		 569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  24.69 
 
 		 545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  29.86 
 
 		 566 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  23.29 
 
 		 551 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  29.59 
 
 		 530 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  25.21 
 
 		 560 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  20.48 
 
 		 578 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5437  type IV secretion pathway protein  24.21 
 
 		 561 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.357309  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5031  PilN  23.99 
 
 		 561 aa  87.8  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  29.64 
 
 		 556 aa  87  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  28.63 
 
 		 563 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  28.63 
 
 		 563 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  21.1 
 
 		 463 aa  67  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  21.82 
 
 		 568 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  20.67 
 
 		 547 aa  65.1  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  21.58 
 
 		 554 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.42 
 
 		 830 aa  60.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  25.58 
 
 		 625 aa  57  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  23.51 
 
 		 534 aa  50.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  20.82 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  24.48 
 
 		 536 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  26.57 
 
 		 779 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  19.49 
 
 		 541 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  22.19 
 
 		 581 aa  44.3  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.13 
 
 		 561 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.13 
 
 		 561 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.13 
 
 		 561 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>