131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2830 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 551 aa  1116    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  33.16 
 
 		 559 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  35.68 
 
 		 566 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  35.66 
 
 		 556 aa  203  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  27.47 
 
 		 577 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  27.66 
 
 		 577 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  32.18 
 
 		 590 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  32.18 
 
 		 590 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  32.25 
 
 		 590 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  32.18 
 
 		 590 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  32.18 
 
 		 590 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  32.25 
 
 		 888 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  32.34 
 
 		 878 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  31.04 
 
 		 564 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  30.63 
 
 		 569 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  30.63 
 
 		 545 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  27.66 
 
 		 560 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  25.79 
 
 		 578 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  28.32 
 
 		 530 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  26.5 
 
 		 547 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  28.04 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4759  hypothetical protein  26.27 
 
 		 596 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  24.49 
 
 		 568 aa  120  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2725  Type II secretory pathway component PulD-like protein  28.52 
 
 		 566 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3705  hypothetical protein  24.23 
 
 		 586 aa  89.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  27.81 
 
 		 563 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  27.81 
 
 		 563 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  24.93 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5437  type IV secretion pathway protein  25.17 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.357309  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5031  PilN  25.17 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.56 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  23.84 
 
 		 559 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  26.1 
 
 		 508 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  25.7 
 
 		 609 aa  73.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  24.27 
 
 		 512 aa  72  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  26.52 
 
 		 506 aa  72  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.7 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  24.48 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  25.15 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  23.44 
 
 		 569 aa  69.7  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  23.25 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  23.04 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.98 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.98 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.98 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.87 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.87 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  24.38 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  26.1 
 
 		 539 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  25.85 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  24.74 
 
 		 537 aa  67  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.46 
 
 		 556 aa  67  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.31 
 
 		 572 aa  67  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  23.15 
 
 		 560 aa  66.6  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  26.49 
 
 		 543 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.91 
 
 		 558 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.94 
 
 		 559 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.94 
 
 		 559 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  23.78 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.23 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  22.62 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  21.88 
 
 		 561 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  26.35 
 
 		 581 aa  63.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.08 
 
 		 574 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4700  hypothetical protein  29.71 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0500  type II secretion system protein, putative  22.89 
 
 		 500 aa  62  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  24.76 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.57 
 
 		 550 aa  61.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.21 
 
 		 577 aa  60.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4249  hypothetical protein  21.55 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6294  hypothetical protein  23.5 
 
 		 600 aa  60.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000464983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  25.77 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.54 
 
 		 562 aa  60.1  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  23.05 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  23.56 
 
 		 536 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4403  Type II secretory pathway component PulD-like  22.22 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  26.8 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  22.75 
 
 		 563 aa  58.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  24.21 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7243  hypothetical protein  27.06 
 
 		 598 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  24.5 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4402  type II and III secretion system protein  21.43 
 
 		 622 aa  57.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  25.32 
 
 		 915 aa  57.4  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  22.87 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  24.1 
 
 		 413 aa  57  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  23.62 
 
 		 547 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  24.83 
 
 		 424 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  25.63 
 
 		 625 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.66 
 
 		 706 aa  55.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  22.26 
 
 		 554 aa  55.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  24.84 
 
 		 704 aa  55.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2850  OmpA/MotB domain protein  24.35 
 
 		 611 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  23.1 
 
 		 733 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.69 
 
 		 506 aa  54.3  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.63 
 
 		 567 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  25.65 
 
 		 887 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  23.96 
 
 		 893 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  25.28 
 
 		 887 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  23.79 
 
 		 424 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0996  type IV pilus secretin PilQ  20.9 
 
 		 864 aa  51.2  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>