35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4232 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  100 
 
 		 540 aa  1095    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4759  hypothetical protein  25.08 
 
 		 596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6294  hypothetical protein  25.12 
 
 		 600 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000464983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  25.64 
 
 		 554 aa  120  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  27.41 
 
 		 888 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  27.59 
 
 		 590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  27.59 
 
 		 590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  27.59 
 
 		 590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  27.59 
 
 		 590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  27.59 
 
 		 590 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  25.83 
 
 		 559 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  24.78 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  27.05 
 
 		 878 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7243  hypothetical protein  24.34 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  24.22 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  26.52 
 
 		 530 aa  102  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  26.03 
 
 		 566 aa  101  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  27.95 
 
 		 556 aa  98.2  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  24.83 
 
 		 564 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  23.31 
 
 		 536 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  24.95 
 
 		 569 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  25.65 
 
 		 545 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  23.43 
 
 		 568 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  24.39 
 
 		 578 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.13 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  25.67 
 
 		 577 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3705  hypothetical protein  24.12 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  24.67 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  22.89 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  24.49 
 
 		 563 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  24.49 
 
 		 563 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  24.37 
 
 		 433 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4700  hypothetical protein  21.74 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  24.14 
 
 		 506 aa  44.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  22.97 
 
 		 546 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>