53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0625 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  100 
 
 		 554 aa  1129    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  40.64 
 
 		 560 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  36.51 
 
 		 530 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  32.57 
 
 		 564 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  30.72 
 
 		 569 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  31.62 
 
 		 545 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  29.98 
 
 		 559 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  30.74 
 
 		 578 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  27.43 
 
 		 568 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  30.83 
 
 		 888 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  30.58 
 
 		 590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  30.83 
 
 		 590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  30.58 
 
 		 590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  30.58 
 
 		 590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  30.58 
 
 		 590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  27.59 
 
 		 577 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  30.98 
 
 		 878 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  27.79 
 
 		 577 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  27.3 
 
 		 566 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  26.57 
 
 		 556 aa  131  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  28.04 
 
 		 551 aa  126  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  23.87 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5031  PilN  24.4 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  23.87 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5437  type IV secretion pathway protein  24.44 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.357309  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  23.14 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  25 
 
 		 540 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4759  hypothetical protein  25.74 
 
 		 596 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7243  hypothetical protein  27.25 
 
 		 598 aa  93.6  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6294  hypothetical protein  25 
 
 		 600 aa  80.1  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000464983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3705  hypothetical protein  22.74 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  23.52 
 
 		 541 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  22.94 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  26.04 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  23.56 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  25.08 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  21.78 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.31 
 
 		 577 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  21.14 
 
 		 536 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  20.39 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  20.49 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  18.49 
 
 		 625 aa  50.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4402  type II and III secretion system protein  24.09 
 
 		 622 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  23.85 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2725  Type II secretory pathway component PulD-like protein  22.61 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  22.3 
 
 		 537 aa  47.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  23.71 
 
 		 470 aa  47.4  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  24.29 
 
 		 470 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0861  general secretion pathway protein D  21.59 
 
 		 759 aa  45.4  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.473391  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4403  Type II secretory pathway component PulD-like  22.65 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  21.57 
 
 		 585 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  20.19 
 
 		 543 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>