34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7243 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7243  hypothetical protein  100 
 
 		 598 aa  1204    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4759  hypothetical protein  48.05 
 
 		 596 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6294  hypothetical protein  38.91 
 
 		 600 aa  365  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000464983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  24.89 
 
 		 534 aa  99.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  23.29 
 
 		 540 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  26.64 
 
 		 554 aa  94  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  25.51 
 
 		 569 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  26.48 
 
 		 536 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  25.22 
 
 		 545 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3705  hypothetical protein  21.76 
 
 		 586 aa  84.3  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  24.64 
 
 		 878 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  24.93 
 
 		 888 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.98 
 
 		 590 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  23.98 
 
 		 590 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.98 
 
 		 590 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.98 
 
 		 590 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.98 
 
 		 590 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.93 
 
 		 530 aa  70.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  22.5 
 
 		 577 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  21.06 
 
 		 560 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  22.47 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  20.44 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  22.34 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.99 
 
 		 559 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  22.68 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  22.84 
 
 		 577 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  22.28 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4249  hypothetical protein  24.48 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5437  type IV secretion pathway protein  24.09 
 
 		 561 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.357309  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  25.71 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5031  PilN  23.72 
 
 		 561 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  25.18 
 
 		 563 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  25.18 
 
 		 563 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.77 
 
 		 830 aa  44.3  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>