170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5240 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 566 aa  1120    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  65.78 
 
 		 556 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  37.85 
 
 		 559 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5663  type IVB pilus formation outer membrane protein  36.21 
 
 		 577 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0603962  normal  0.0114433 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  40.92 
 
 		 577 aa  279  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  42.39 
 
 		 878 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  41.34 
 
 		 590 aa  276  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  41.34 
 
 		 888 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  41.34 
 
 		 590 aa  276  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  41.34 
 
 		 590 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  41.34 
 
 		 590 aa  276  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  41.34 
 
 		 590 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0014  PilN family type IV pilus biogenesis protein  35.08 
 
 		 564 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  33.57 
 
 		 569 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  38.56 
 
 		 545 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  36.24 
 
 		 551 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1517  type II and III secretion system protein  31.4 
 
 		 578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0117  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  29.57 
 
 		 560 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.909577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  28.55 
 
 		 530 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0060  PilN family type IV pilus biogenesis protein  26.83 
 
 		 568 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  28.64 
 
 		 554 aa  163  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5198  type IV secretion pathway protein  29.39 
 
 		 563 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1533  PilN  29.39 
 
 		 563 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.261207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5031  PilN  25.95 
 
 		 561 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5437  type IV secretion pathway protein  26.24 
 
 		 561 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.357309  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4203  Type II secretory pathway component PulD-like  24.14 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  26.25 
 
 		 534 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2725  Type II secretory pathway component PulD-like protein  29.93 
 
 		 566 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  27.95 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4232  lipoprotein  25.84 
 
 		 540 aa  96.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3705  hypothetical protein  24.44 
 
 		 586 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4759  hypothetical protein  24.07 
 
 		 596 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.81 
 
 		 563 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.63 
 
 		 567 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.65 
 
 		 556 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  24.01 
 
 		 569 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  24.07 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.94 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.08 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  26.02 
 
 		 560 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.47 
 
 		 561 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.47 
 
 		 561 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.47 
 
 		 561 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  26.42 
 
 		 561 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  27.55 
 
 		 559 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  24.61 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  21.43 
 
 		 563 aa  73.9  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  26.13 
 
 		 549 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  26.42 
 
 		 546 aa  72  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  23.97 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7243  hypothetical protein  23.45 
 
 		 598 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.14 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  24.03 
 
 		 530 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  24.69 
 
 		 554 aa  71.2  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.58 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  21.71 
 
 		 506 aa  70.5  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  24.63 
 
 		 614 aa  70.5  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  23.49 
 
 		 470 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  27.48 
 
 		 609 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  22.11 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  23.03 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.07 
 
 		 577 aa  68.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.67 
 
 		 538 aa  68.2  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  24.45 
 
 		 512 aa  67  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.51 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.81 
 
 		 559 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.81 
 
 		 559 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.51 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.96 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  24 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  23.62 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  23.88 
 
 		 733 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  23.12 
 
 		 537 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  25.6 
 
 		 779 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.38 
 
 		 550 aa  61.6  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  24.51 
 
 		 767 aa  61.2  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  27.04 
 
 		 581 aa  61.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  23.47 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6294  hypothetical protein  23.08 
 
 		 600 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000464983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  25.85 
 
 		 539 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0356  toxin co-regulated pilus biosynthesis outer membrane protein C  22.04 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.903554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  25.93 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  25.71 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  24.6 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  24.76 
 
 		 585 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  24.76 
 
 		 775 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  25 
 
 		 803 aa  56.2  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  23.73 
 
 		 625 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  23.28 
 
 		 819 aa  54.7  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  24.02 
 
 		 799 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  24.43 
 
 		 775 aa  54.7  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  23.73 
 
 		 625 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1980  type IV pilus secretin PilQ  24.01 
 
 		 693 aa  53.9  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0209745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  25.77 
 
 		 689 aa  53.9  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  24.32 
 
 		 667 aa  53.9  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  24.81 
 
 		 833 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  24.44 
 
 		 681 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  25.35 
 
 		 660 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  26.07 
 
 		 776 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0799  type II secretion system protein  24.16 
 
 		 486 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>