108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0725 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0725  Type II secretory pathway component PulD-like  100 
 
 		 488 aa  955    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0680594  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5909  type IVB pilus formation outer membrane protein  25.85 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918767  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  19.71 
 
 		 538 aa  77  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0769  type IV pilus biogenesis protein PilN, putative  23.76 
 
 		 878 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  23.38 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  24.03 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  23.38 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  23.94 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1610  putative type IV pilus biogenesis protein PilN  23.7 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0615658  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1979  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.7 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.222208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2257  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.7 
 
 		 590 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2173  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.7 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00887816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0658  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.7 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0657  hypothetical protein  23.26 
 
 		 888 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  20.61 
 
 		 733 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  21.53 
 
 		 581 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.86 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  22.94 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  19.54 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  20.57 
 
 		 561 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  20.57 
 
 		 561 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  20.57 
 
 		 561 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5451  type II and III secretion system protein  29.46 
 
 		 556 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0297811  normal  0.024841 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5880  type IVB pilus formation outer membrane protein  24.13 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.35 
 
 		 567 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  20.92 
 
 		 559 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  20.92 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0625  type IVB pilus formation outer membrane protein, R64 PilN family  20.6 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  22.05 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5240  type II and III secretion system protein  25.31 
 
 		 566 aa  57  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  19.43 
 
 		 562 aa  57  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  27.37 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  20.21 
 
 		 572 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  22.22 
 
 		 784 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  21.85 
 
 		 776 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  23.1 
 
 		 745 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  22.03 
 
 		 779 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  24.06 
 
 		 463 aa  54.3  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  23.3 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  21.55 
 
 		 751 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  27.01 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  27.01 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  22.5 
 
 		 766 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  20.23 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  21.31 
 
 		 763 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  24.16 
 
 		 539 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  20.79 
 
 		 554 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  24.01 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  21.1 
 
 		 577 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  20.07 
 
 		 556 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  22.47 
 
 		 494 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  21.31 
 
 		 775 aa  50.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3512  Type III secretion system outer membrane pore YscC/HrcC  27.18 
 
 		 681 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4854  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.18 
 
 		 681 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5430  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  27.18 
 
 		 681 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128772  normal  0.061937 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  23.53 
 
 		 541 aa  48.9  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  21.04 
 
 		 775 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 580 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  23.18 
 
 		 780 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5552  type II secretory pathway component PulD-like protein  21.62 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0544436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59250  Type IV B pilus protein  24.4 
 
 		 545 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0179711  hitchhiker  0.0000153771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  25.17 
 
 		 751 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1626  type II and III secretion system protein  21.69 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4471  type IVB pilus formation outer membrane protein  23.64 
 
 		 569 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  24.48 
 
 		 829 aa  47.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  30.83 
 
 		 756 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  21.81 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  19.72 
 
 		 803 aa  47.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  22.96 
 
 		 491 aa  47.4  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1699  type II and III secretion system protein  20.9 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0103666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  18.77 
 
 		 530 aa  47.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4228  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  26.7 
 
 		 681 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  18.75 
 
 		 530 aa  47  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  22.15 
 
 		 681 aa  47  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2830  type II and III secretion system protein  22.57 
 
 		 551 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.218706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4751  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  26.7 
 
 		 680 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6564  type II secretory pathway component PulD-like protein  21.24 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  19.37 
 
 		 801 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  25.25 
 
 		 660 aa  46.6  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5069  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  22.57 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.240332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  21.59 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  21.59 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  19.05 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  20.89 
 
 		 561 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  18.97 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  21.59 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2249  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.37 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570406  normal  0.0166215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3741  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  26.21 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452401  normal  0.0121623 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  19.18 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  21.59 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  22.83 
 
 		 793 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  22.11 
 
 		 574 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  26.94 
 
 		 805 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  21.72 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1946  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  24.2 
 
 		 491 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  20.65 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  22.92 
 
 		 719 aa  44.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  21.69 
 
 		 499 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1300  type II secretion system protein D  25.4 
 
 		 667 aa  44.3  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.194357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3734  type IVB pilus formation outer membrane protein  19.01 
 
 		 530 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>