74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0165 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 244 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  56.33 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  57.66 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  55.41 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  51.1 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  56.09 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  53.39 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  54.51 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  52.7 
 
 		 245 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  53.47 
 
 		 253 aa  211  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  52.86 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  48.76 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  50.82 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  50 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  54.39 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  49.58 
 
 		 259 aa  205  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  49.58 
 
 		 259 aa  205  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  58.3 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  56.17 
 
 		 244 aa  201  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  53.14 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  48.97 
 
 		 254 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  48.77 
 
 		 265 aa  198  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  54.47 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  54.5 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  52.02 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  52.29 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  46.98 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  54.5 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  54.39 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  55.11 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  57.8 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  49.15 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  46.55 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  45.12 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  46.72 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  45.12 
 
 		 251 aa  188  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  58.37 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  45.15 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  47.47 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  45 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  45.78 
 
 		 242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  47.11 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  53.91 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  45.98 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  44.81 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  47 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  46.84 
 
 		 245 aa  174  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  45.83 
 
 		 241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  46.06 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  46.06 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  43.11 
 
 		 242 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  45.64 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  44.2 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  44.95 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  32.83 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.98 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  27.51 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  24.62 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  24.39 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0368  trbJ protein  28.87 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  25.1 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  23.72 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  26.32 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  31.51 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  30.41 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.49 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.27 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  24.59 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  27.56 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  25.6 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  29.7 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1720  conjugal transfer protein TrbJ  29.88 
 
 		 243 aa  45.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196302  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6627  conjugal transfer protein TrbJ  26.39 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331539  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6510  conjugal transfer protein TrbJ  26.39 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>