73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1899 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  98.33 
 
 		 241 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  94.56 
 
 		 241 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  94.14 
 
 		 241 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  90 
 
 		 242 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  93.18 
 
 		 246 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  84.52 
 
 		 251 aa  401  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  84.52 
 
 		 251 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  89.83 
 
 		 245 aa  397  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  81.17 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  75.1 
 
 		 245 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  75.41 
 
 		 247 aa  361  6e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  81.48 
 
 		 245 aa  355  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  74.58 
 
 		 247 aa  354  6.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  77.69 
 
 		 242 aa  351  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  78.28 
 
 		 245 aa  324  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  68.98 
 
 		 243 aa  297  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  65.02 
 
 		 242 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  46.69 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  48.48 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  42.98 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  46.78 
 
 		 259 aa  174  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  46.78 
 
 		 259 aa  174  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  45.5 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  44.49 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  49.08 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  48.48 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  47.35 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  48.87 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  46.06 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  49.36 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  45.89 
 
 		 254 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  45.23 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  47.27 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  44.4 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  44.49 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  46.79 
 
 		 266 aa  158  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  46.41 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  48.19 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  44.44 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  44.44 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  45.57 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  47.7 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  42.79 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  42.74 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  44.78 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  47.73 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  41.18 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  43.15 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  43.27 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  42.54 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  45.13 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  41.89 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  31.16 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.8 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  33.33 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  34.09 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  25 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  27.1 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  25 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  25.76 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.72 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  23.5 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  26.53 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.53 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  25.63 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  24.49 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3193  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  30.36 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2845  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.12 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13713  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_002950  PG1480  conjugative transposon protein TraI  31.67 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.886511 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.29 
 
 		 252 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>