64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2272 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 
243 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  65.43 
 
 
254 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  58.01 
 
 
245 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  60.53 
 
 
244 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  58.68 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  59.58 
 
 
253 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  59.17 
 
 
253 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  59.91 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  62.56 
 
 
244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  58.17 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  58.04 
 
 
253 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  53.78 
 
 
259 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  53.78 
 
 
259 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  53.01 
 
 
253 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  58.02 
 
 
244 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  53.42 
 
 
260 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  52.24 
 
 
265 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  55.77 
 
 
266 aa  201  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  56.25 
 
 
254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  57.96 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  56.59 
 
 
244 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  57.87 
 
 
256 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  52.65 
 
 
244 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  62.22 
 
 
245 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  59.09 
 
 
252 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  48.83 
 
 
249 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  53.95 
 
 
245 aa  184  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  45.23 
 
 
248 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  56.44 
 
 
258 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  58.22 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  53.77 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  53.27 
 
 
248 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  59.39 
 
 
238 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  42.68 
 
 
247 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  45.79 
 
 
243 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  42.19 
 
 
241 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  42.68 
 
 
247 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  45.05 
 
 
246 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  42.72 
 
 
241 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  42.54 
 
 
245 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  43.38 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  41.78 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  40.82 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  42.65 
 
 
245 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  42.86 
 
 
242 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  41.25 
 
 
251 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  41.98 
 
 
242 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  43.72 
 
 
245 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  43.05 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  41.6 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  41.77 
 
 
241 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  41.77 
 
 
241 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  41.35 
 
 
241 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  39.92 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  32.08 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.75 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  34.39 
 
 
237 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  23.22 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.81 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  35.82 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.31 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  26.63 
 
 
266 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  29.2 
 
 
261 aa  41.6  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  30.24 
 
 
239 aa  42  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>