23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4693 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  26.32 
 
 
269 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  26.94 
 
 
262 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  27.8 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  27.35 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  25.69 
 
 
266 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  26.61 
 
 
269 aa  92  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  31.58 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0368  trbJ protein  26.22 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.42 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  23.23 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2845  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.21 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13713  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3193  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.14 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  21.55 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2647  conjugal transfer protein TrbJ  26.07 
 
 
264 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783704  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  24.89 
 
 
242 aa  48.9  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1341  P-type conjugative transfer protein TrbJ  23.81 
 
 
246 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal  0.391023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  26.06 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1640  conjugal transfer protein trbJ, putative  23.28 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.894156  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  23 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  27.32 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0249  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.34 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  25.24 
 
 
254 aa  42.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>