72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2354 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  87.4 
 
 		 247 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  85.02 
 
 		 245 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  81.15 
 
 		 247 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  88.99 
 
 		 245 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  94.57 
 
 		 245 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  77.69 
 
 		 241 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  77.69 
 
 		 241 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  77.69 
 
 		 241 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  77.69 
 
 		 241 aa  348  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  74.27 
 
 		 242 aa  344  6e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  72.95 
 
 		 251 aa  343  8.999999999999999e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  78.18 
 
 		 246 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  72.54 
 
 		 251 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  75.21 
 
 		 241 aa  337  8e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  74.9 
 
 		 245 aa  337  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  70.78 
 
 		 251 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  70.05 
 
 		 243 aa  308  6.999999999999999e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  64.63 
 
 		 242 aa  305  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  47.13 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  44.02 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  49.79 
 
 		 253 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  48.9 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  49.78 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  47.9 
 
 		 253 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  45 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  42.25 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  42.25 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  47.93 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  44.78 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  44.26 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  47.47 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  41.89 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  48.73 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  47.25 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  47.25 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  47.54 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  42.68 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  40.83 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  45.82 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  43.5 
 
 		 253 aa  154  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  44.55 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  43.69 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  45.45 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  45.18 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  47.16 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  41.26 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  44.12 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  39.34 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  45.5 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  43.38 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  43.65 
 
 		 239 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  44.69 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  43.93 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  35.74 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  35.91 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.5 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.59 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  32.46 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.8 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6510  conjugal transfer protein TrbJ  30 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225692  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6627  conjugal transfer protein TrbJ  30 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331539  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  30.73 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  22.28 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.78 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  28.4 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  29.02 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  27.68 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  23.84 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  30.38 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  24.23 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1720  conjugal transfer protein TrbJ  29.27 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>