64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1144 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 
243 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  70.39 
 
 
247 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  70.82 
 
 
247 aa  335  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  68.67 
 
 
245 aa  331  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  70.4 
 
 
245 aa  321  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  65.4 
 
 
251 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  66.24 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  66.24 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  69.59 
 
 
241 aa  301  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  68.52 
 
 
246 aa  295  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  66.24 
 
 
242 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  68.61 
 
 
245 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  67.98 
 
 
245 aa  291  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  66.36 
 
 
242 aa  291  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  68.66 
 
 
241 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  69.3 
 
 
241 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  69.3 
 
 
241 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  68.06 
 
 
241 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  56.14 
 
 
242 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  43.22 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  45.26 
 
 
245 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  47.6 
 
 
253 aa  168  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  47.95 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  45.8 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  46.19 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  48.91 
 
 
253 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  43.85 
 
 
259 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  43.85 
 
 
259 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  43.89 
 
 
249 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  47.56 
 
 
253 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  47.6 
 
 
253 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  45.76 
 
 
265 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  45.7 
 
 
254 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  45.16 
 
 
245 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  47 
 
 
244 aa  155  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  42.13 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  44.26 
 
 
244 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  44.84 
 
 
260 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  48.55 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  46.89 
 
 
266 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  45.19 
 
 
253 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  48.44 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  46.12 
 
 
244 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  40.98 
 
 
244 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  48.48 
 
 
256 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  48.37 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  45.11 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  42.52 
 
 
248 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  45.79 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  43.52 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  39.11 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  38.2 
 
 
239 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  41.78 
 
 
238 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  43.22 
 
 
240 aa  98.6  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.2 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  33.7 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  27.45 
 
 
262 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  29.06 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  25.86 
 
 
269 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.19 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.74 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  31.93 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  25.79 
 
 
266 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.9 
 
 
258 aa  42  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>