65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7444 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 248 aa  480  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  62.7 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  54.47 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  57.2 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  59.91 
 
 		 254 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  59.43 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  55.82 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  51.78 
 
 		 259 aa  228  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  51.78 
 
 		 259 aa  228  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  58.64 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  50.78 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  52.52 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  61.23 
 
 		 245 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  58.85 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  54.62 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  58.61 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  55.76 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  53.94 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  54.84 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  60.99 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  52.42 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  55.3 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  53.97 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  51.21 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  48.23 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  57.06 
 
 		 244 aa  205  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  53.63 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  52.61 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  54.5 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  49.38 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  54.11 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  52.66 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  43.81 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  40.68 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  45.19 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  42.02 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  45.07 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  44.92 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  45.19 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  41.39 
 
 		 245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  44.29 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  45.71 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  43.69 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  40.49 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  53.78 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  45.53 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  43 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  43.8 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  43.8 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  44.64 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  43.57 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  42.51 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  41.7 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  40.17 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  35.5 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.2 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  32.97 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  34.85 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  24.31 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  28.65 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  39.39 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.57 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.84 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  25.15 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  27.95 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>