72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3502 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  98.01 
 
 		 251 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  90.04 
 
 		 251 aa  454  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  90.83 
 
 		 242 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  88 
 
 		 241 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  87.96 
 
 		 246 aa  384  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  84.1 
 
 		 241 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  84.52 
 
 		 241 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  84.52 
 
 		 241 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  82.92 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  79.92 
 
 		 245 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  72.69 
 
 		 247 aa  349  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  72.47 
 
 		 247 aa  348  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  72.69 
 
 		 245 aa  348  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  76.21 
 
 		 245 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  72.95 
 
 		 242 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  74.56 
 
 		 245 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  69.59 
 
 		 243 aa  301  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  61.33 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  47.95 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  47.95 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  47.06 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  50.44 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  49.54 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  50 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  47.77 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  47.52 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  43.88 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  43.64 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  48.72 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  48.23 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  44.24 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  48.96 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  50 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  47.2 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  47.33 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  47.47 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  48.13 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  47.22 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  46.08 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  51.97 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  46.33 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  48.09 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  47.54 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  42.62 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  43.51 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  41 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  41.81 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  46.02 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  46.79 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  43.78 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  42.02 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  46.05 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  44.7 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.02 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  26.47 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.28 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  25 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  27.74 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  34.81 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  31.03 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  27.78 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  27.23 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.87 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2845  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.93 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13713  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3193  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.34 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.84 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  25.48 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  28.03 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  25 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  22.81 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  22.36 
 
 		 257 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>