65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2320 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 
253 aa  497  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  77.87 
 
 
253 aa  351  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  79.05 
 
 
253 aa  352  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  78.71 
 
 
254 aa  345  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  71.88 
 
 
259 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  71.88 
 
 
259 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  75.49 
 
 
253 aa  341  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  77.73 
 
 
260 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  72.58 
 
 
260 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  72.13 
 
 
265 aa  332  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  74.79 
 
 
254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  71.54 
 
 
253 aa  323  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  77.29 
 
 
253 aa  318  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  75.93 
 
 
266 aa  314  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  78.54 
 
 
252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  73.52 
 
 
256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  63.75 
 
 
245 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  63.67 
 
 
244 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  65.12 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  66.97 
 
 
244 aa  261  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  64.9 
 
 
244 aa  258  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  67.42 
 
 
245 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  50.9 
 
 
249 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  54.26 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  54.88 
 
 
244 aa  207  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  53.52 
 
 
246 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  58.04 
 
 
243 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  57.21 
 
 
248 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  47.6 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  47.98 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  48.67 
 
 
241 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  47.77 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  48.59 
 
 
251 aa  194  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  51.6 
 
 
242 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  49.37 
 
 
244 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  45.53 
 
 
247 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  46.15 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  55.31 
 
 
258 aa  189  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  48.86 
 
 
242 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  55.25 
 
 
239 aa  188  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  46.91 
 
 
247 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  49.28 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  45 
 
 
242 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  57.92 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  48.8 
 
 
243 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  51.11 
 
 
241 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  57.69 
 
 
238 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  48.61 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  48.95 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  48.48 
 
 
241 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  48.48 
 
 
241 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  48.05 
 
 
241 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  42.28 
 
 
241 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  40.98 
 
 
242 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.03 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  23.46 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  25.23 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  27.33 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.09 
 
 
250 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  30.13 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  34.3 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.25 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  29.34 
 
 
265 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  25 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  30.43 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>